本实验测定了无棘刺萼花臂尾轮虫线粒体基因组全序列及有棘刺萼花臂尾轮虫部分线粒体基因组序列，运用的方法主要有轮虫单克隆培养、DNA提取、引物设计、PCR扩增、产物鉴定与纯化、DNA序列测定与分析。　　实验结果显示无棘刺萼花臂尾轮虫线粒体基因组由两个DNA环组成，分别命名为mtDNA-I（10062 bp）、mtDNA-II（10150 bp）。无棘刺萼花臂尾轮虫线粒体基因组包含8个蛋白编码基因（ND1、ND2和ATP6位于mtDNA-I；ND3、ND4、ND4L、ND5和ND6位于mtDNA-II）、18个tRNA编码基因（13个位于mtDNA-I）以及2个rRNA编码基因（位于mtDNA-I），两个DNA环上各有一段6000 bp左右的非编码区，同源性高达99%。8个蛋白编码基因中，ND4和ND5蛋白编码基因的起始密码子为ATA，其余蛋白编码基因起始密码子均为ATG。除ND1蛋白编码基因的终止密码子为ATA，其余蛋白编码基因终止密码均为TAA。无棘刺萼花臂尾轮虫线粒体基因组AT碱基含量非常丰富， mtDNA-I环上A+T=69.66%， mtDNA-II环上A+T=69.47%。　　有棘刺萼花臂尾轮虫mtDNA-I总长10241 bp，包含3个蛋白编码基因， A+T=70.33%，AT碱基含量比无棘刺萼花臂尾轮虫mtDNA-I高。有棘刺萼花臂尾轮虫mtDNA-I含有12个tRNA编码基因比无棘刺萼花臂尾轮虫mtDNA-I少一个tRNA-Arg。有棘刺萼花臂尾轮虫mtDNA-I组成同无棘刺萼花臂尾轮虫mtDNA-I类似。　　将本研究测定的萼花臂尾轮虫线粒体基因组结合Genbank中10种轮形动物门物种和本实验室研究的3种臂尾轮虫线粒体基因组，以Microcotyle sebastis为外群，基于7种蛋白质编码基因（ND1、ND2、ND3、ND4、DN5、ND6、ATP6）序列，利用Mega6.0软件进行序列比对和分析，运用NJ法重建了分子系统树，对轮形动物门14种动物的系统发生关系进行探讨。