本研究以38只乌珠穆沁羊与22只苏尼特羊为研究对象,利用PCR技术,首次成功地克隆了绵羊的Hoxc8基因1673bp的片段,包括全部内含子和大部分外显子。同时也比对了乌珠穆沁羊与苏尼特羊的Hoxc8基因序列,实验结果表明:苏尼特羊Hoxc8基因序列第373处为C,而乌珠穆沁羊突变为T。苏尼特羊Hoxc8基因序列第576处为T,而乌珠穆沁羊Hoxc8基因序列中突变为A。苏尼特羊Hoxc8基因序列第655和656处为C和G,乌珠穆沁羊Hoxc8基因序列中突变为T和A。苏尼特羊Hoxc8基因序列第727处中A缺失。苏尼特羊Hoxc8基因序列第1031处为A,乌珠穆沁羊Hoxc8基因序列中突变为T。苏尼特羊Hoxc8基因序列第1566处为T,乌珠穆沁羊Hoxc8基因序列突变为C等七处不同。比对绵羊与几种动物的同源性时发现外显子有很高的同源性,且内含子中有四个部分是高度保守的,长度分别在20bp左右。本实验同时比对了乌珠穆沁羊和苏尼特羊的Hoxa11、Hoxd11和Hoxc8基因的部分外显子区域的核苷酸序列。比对结果表明:扩增出的Hoxa11基因第二外显子大小为192bp片段,乌珠穆沁羊序列中有一个核苷酸的缺失和两个核苷酸的突变;扩增出的Hoxd11基因第二外显子的大小为151bp片段(GenBank登录号:GQ300854),乌珠穆沁羊序列中有一个核苷酸的突变;扩增出的Hoxc8基因第一外显子的大小为327bp片段,乌珠穆沁羊和苏尼特羊之间没有差异。