都柳江鲇形目主要经济鱼类种质的遗传学评价

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鲇(Silurus asotus)、粗唇鮠(Leiocassis crassilabris)和斑鱯(Hemibagrus guttatus)均隶属鲇形目(Siluriformes),且均为我国重要淡水经济鱼类。近年来,该3种鱼类在贵州都柳江受到了高强度的捕捞,加之水环境污染和水利工程等造成的鱼类栖息环境破坏,其野生资源量日趋减少,而物种的遗传多样性与其适应能力、生存能力密切相关。目前,尚无有关都柳江鲇、粗唇鮠和斑鳠野生种群遗传多样性研究的报道,因此,本研究以都柳江该3种鱼类种群为研究对象,采用PCR和DNA测序技术研究了该3种鱼类线粒体DNA Cyt b基因和D-loop序列组成及遗传多样性,进行其种质的遗传学评价,以期为开展都柳江该3种经济鱼类种质资源的利用及保护提供科学依据。主要结果如下:1、以采自都柳江39尾鲇个体为样品,采用PCR和DNA测序技术对都柳江鲇种群Cyt b基因和D-loop序列进行了分析。获取了长度为1122 bp和D-loop 5′端长度为544~545 bp的鲇Cyt b基因、D-loop序列。在Cyt b基因中,检测到46个多态位点,变异多发生在密码子第3位点,且多为同义突变。4种碱基在密码子上分布上具有明显的偏倚性。在D-loop序列中,检测到58个变异位点,其中多态位点51个。对鲇D-loop序列结构进行了分析,识别了鲇D-loop终止序列区和中央保守区等的特征序列。2、都柳江鲇种群Cyt b基因、D-loop序列中,分别有46、51个多态位点,均定义了11种单倍型。都柳江鲇种群Cyt b基因和D-loop序列的单倍型多样性指数和核苷酸多样性指数分别为0.646、0.008 99和0.772、0.023 01。基于D-loop序列的都柳江鲇种群遗传多样性水平较Cyt b基因的要高。都柳江鲇种群大小稳定,具有较丰富的遗传多样性。3、本研究中,获取了都柳江40尾粗唇鮠Cyt b基因和D-loop长度分别为1118 bp和776~778 bp的序列。在Cyt b基因中,检测到3个多态位点,变异多发生在密码子第3位点,且多为同义突变。4种碱基在密码子上分布上具有明显的偏倚性。在D-loop序列中,检测到26个变异位点,其中多态位点20个。对粗唇鮠D-loop序列结构进行了分析,识别了粗唇鮠D-loop终止序列区、中央保守区和保守序列区等的特征序列。4、都柳江粗唇鮠种群Cyt b基因、D-loop序列中,分别有3、20个多态位点,且分别定义了4、10种单倍型。都柳江粗唇鮠种群Cyt b基因和D-loop序列的单倍型多样性指数和核苷酸多样性指数分别为0.146、0.000 13和0.404、0.00317。基于D-loop序列的都柳江粗唇鮠种群遗传多样性水平较Cyt b基因的要高。都柳江粗唇鮠种群遗传多样性较低。5、获得了都柳江39尾斑鱯Cyt b基因长度为1122 bp和D-loop 5′端长度为546~547 bp的序列。在Cyt b基因中,检测到15个多态位点,变异多发生在密码子第3位点,且多为同义突变。4种碱基在密码子上分布上具有明显的偏倚性。在D-loop序列中,检测到15个变异位点,其中多态位点12个。对斑鱯D-loop序列结构进行了分析,识别了斑鱯D-loop终止序列区和中央保守区等的特征序列。6、都柳江斑鱯种群Cyt b基因、D-loop序列中,分别有15、12个多态位点,且分别定义了10、8种单倍型。都柳江斑鱯种群Cyt b基因和D-loop序列的单倍型多样性指数和核苷酸多样性指数分别为0.610、0.001 01和0.331、0.001 31。基于D-loop序列的都柳江斑鱯种群遗传多样性水平较Cyt b基因的要低。都柳江斑鳠种群遗传多样性较为匮乏。7、进行都柳江鲇种群种质遗传学评价时,Cyt b基因和D-loop序列均可作为该种群评价的分子标记;进行都柳江粗唇鮠种群种质遗传学评价时,D-loop序列更适合作为该种群评价的分子标记;进行都柳江斑鱯种群种质遗传学评价时,Cyt b基因更适合作为该种群评价的分子标记。
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