自2003年开始的农信社改革取得了阶段性的成果，改革试点的第一阶段工作任务已经基本完成，产权制度实现重大突破，新的管理体制框架基本确立，资产质量不断提高，各项业务稳步发展。为更好地服务“三农”，促进新农村的建设，作为农村金融的主力军，农信社仍将顺应时代潮流，继续深化改革。与此同时，随着农村金融的不断改革，农村金融多元化市场已经逐渐形成，金融市场逐渐由卖方市场转向了买方市场，农村金融市场也将出现由产权改革为主导转向以经营管理为主体的竞争格局。可见，通过经营创新来提升农信社提供金融服务的能力，从而实现可持续发展将是全国农信社下一步改革中非常必要的一个重点内容，本研究在CIS和流程银行相结合的视角下研究农村信用社的经营创新问题。 本研究以中国加入世界贸易组织五年之后的金融全面开放、农村金融改革的逐步推行、农村金融市场多元化以及农村信用社的改革现状和未来面临的挑战为现实背景，通过对CIS理论和“流程银行”理论的回顾与借鉴，以此为起点确立了本研究的逻辑起点和研究视角：在此基础上，从该视角下确定了农村信用社可持续发展经营创新的概念框架，进行了CIS和流程银行相结合的理论可行性分析，界定CIS和流程银行相结合的概念，并总结了两者的结合原则，构建了两者相结合的模型；从农信社改革现状、存在问题、问题成因和面临挑战等四个方面分析了农信社的宏观状态，其中分析存在问题和问题存因是建立在两份调查问卷的基础上的；通过借鉴国外经验(美国花旗银行的经验和孟加拉国的小额信贷经验)和总结国内实践(杭州合作银行的实践)，提出CIS和流程银行相结合的包括业务流程再造、人事系统再造、管理系统再造、信息技术再造和组织结构再造等五个方面的具体操作建议，并简单选择了衡量在该视角下的农信社经营创新是否成功的指标和各指标应用的方法。