目的:研究上皮-间质转化(Epithelial-mesenchymal transition,EMT)信号通路相关长链非编码RNA(Long non-coding RNA,LncRNA)在胃癌组织及癌旁胃粘膜组织中的差异表达,探索代表性EMT相关lncRNA在胃癌临床诊断中的潜在价值。方法:收集胃癌组织及癌旁胃粘膜组织,应用LncPath Human EMT Pathway LncRNA Microarray检测胃癌组织和癌旁胃粘膜组织EMT相关lncRNA和相关靶基因的表达水平,筛选出表达差异明显的lncRNA,并绘制与相关靶基因相互作用图。实时定量逆转录-聚合酶链式反应(quantitative reverse transcription-polymerase chain reaction,qRT-PCR)检测胃癌组织、癌旁胃粘膜组织、胃癌细胞株BGC-823及正常胃粘膜细胞GES-1 lncRNA metallothionein 1J,pseudogene(MT1JP)和mRNA-metallothionein 1M(MT1M)的表达水平。结合临床资料分析,MT1JP和MT1M表达水平与患者临床病理因素之间的相关性,探索其在临床诊断中的潜在价值。结果:胃癌组织与癌旁胃粘膜组织之间表达差异超过2倍lncRNA有26条,有16条明显上调,10条明显下调;qRT-PCR检测结果LncRNA-MT1JP和靶基因mRNAMT1M的表达水平在胃癌组织中降低,MT1JP表达水平与肿瘤大小、分期、淋巴转移、远处转移、TNM分期相关(P<0.05)。MT1JP在胃癌前病变、早期胃癌中及进展期胃癌中表达依次降低。结论:胃癌中大量EMT相关lncRNA异常表达,可能通过EMT相关信号通路在胃癌发展中发挥调节作用。MT1JP和MT1M在胃癌组织中低表达,与肿瘤的分期及浸润程度具有相关性。MT1JP在癌前病变及早期胃癌中低表达,可能是潜在的胃癌分子诊断和治疗的靶标。