高等教育是教育体系的最高阶段，随着知识经济的日益增长，高等教育对社会发展的作用也日益受到重视。随着教育市场的逐步形成，大学之间竞争的日益加剧，高等院校已经不再是一个单纯的教育者，而是政府投资的使用者和经营者。如何提高高等教育的资源配置效率和使用效率已成为不可忽略的一个问题。大学管辖下的各院系必须树立成本意识和效益观念，充分优化资源配置，提高教育资源的利用率，从而提高学院的办学效益。因此对高校内各院系投入产出效率进行研究具有非常重要的现实意义。　　本文首先分析了高等教育的发展现状，指出用数据包络来分析（Date envelopment analysis）高校投入产出效率的可行性和优越性，并对数据包络分析方法进行介绍；随后根据投入产出指标确立的依据和原则，选取了本文的研究指标，建立指标体系；在此基础上，运用某高等院校院系的数据进行DEA有效性分析和规模效益分析，测算出经济效益评价指标、松弛变量、各投入产出的权重系数等多项分析参数；然后，根据各个院系的经营效益做出评价，为院系资源配置的合理性、资源利用的有效程度、导致经营无效的因素分析提供依据；最后对高校和各院系的发展提供了政策建议，希望对高校和学院的发展提供帮助。