过氧化物酶比活力测定结果显示，抗性品种苏麦3号和望水白在接种赤霉病菌孢子后的6天内，过氧化物酶（POD）比活力明显高于对照，中抗品种扬麦158比对照也略有增加，而感病品种宁麦6号和安农8455则与对照无差异。用FPLC方法分析了小麦抗赤霉病程度不同的各个小麦品种穗组织盐溶成份。结果表明，所有抗性品种在用病原物接种或过氧化氢处理后，蛋白质P₀的吸收峰明显增高，而在感性品种中差异不明显，P₀是与小麦抗赤霉病相关的蛋白。对照样品在过氧化氢水浴（35℃）处理后，抗性品种的蛋白峰有“左移”现象，P₀峰有所提高，表现与赤霉病菌接种处理一致的趋势，因而，在H₂O₂存在的前提下，抗性品种中POD活力的提高促使小分子量物质聚合成大分子量的蛋白，而在感性品种中没有这些变化的出现。 用FPLC方法分析了抗赤霉病程度不同的5个小麦品种的成熟种子愈伤组织在用脱氧雪腐镰刀菌烯醇（DON）处理后的盐溶性蛋白组分的变化。研究结果表明，所有品种都含有4个洗脱体积为8ml（P₀）、18.20ml（P₁）、20.20ml（P₂）和20.80ml（P₃）的蛋白吸收峰。DON处理后，抗病品种的这些吸收峰明显增高，而感病品种中这些吸收峰的相对含量有下降的趋势，这些蛋白质可能与小麦的抗病性相关。愈伤组织样品经过氧化氢温育（35℃）处理后，抗性品种的蛋白图谱与用毒素处理愈伤组织的蛋白图谱相同，进一步证实了小麦在抗赤霉病过程中蛋白的变化是以过氧化氢介导的，而在感病品种中则没有这样的变化。 在田间接种小麦赤霉病菌的孢子后，3个以苏麦3号为背景的小麦近等基因系在蛋白含量的变化上没有明显的规律。抗性最强的品系经接种处理后，过氧化物酶比活力明显高于对照，抗性较弱和抗性弱的品系接种样品的过氧化物酶比活力大部分时间段内低于对照水平。抗性最强品系在接种赤霉病菌后的8天后，洗脱体积为8ml（P₀）的蛋白质的量比对照显著增加，而其他两个品系则没有该现象出现。