2020年暴发的新冠肺炎疫情（COVID-19）既是对应急治理能力的考验,更是对我国健康法治体系建设的检验。疫情防控期间频发的妨害传染病防治等涉疫情犯罪与隐私泄露侵权事件激发了权利冲突下的社会矛盾。本研究以我国COVID-19防控实践为研究背景,以法定传染病疫情防控期间医患双方、个人与公众的权利冲突表现及相关案例为研究对象,正文共分为四个部分。第一部分主要讨论法定传染病防治领域权利保护的理论基础。首先明确涉疫情相关权利主体的范围;其次详细解析疫情防治中传染病确诊和疑似患者及其密切接触者、医护人员与其他疾病患者和普通公众三类主体享有的具体权利。第二部分重点分析立足于传染病防治领域医患权利保护的立法现状与实践现状,结合疫情防控实践探讨医患权利保护与化解权利冲突的现实困境。第三部分探究法定传染病防治领域相关主体产生权利冲突的原因。我国传染病防治领域还存在患方权利减损不当、医方权利保障体系不健全的法律问题。理论层面的权利冲突由法理因素与伦理道德因素导致;疫情防控实践层面,医患双方个人因素、社会因素等均对医患权利冲突施加不同程度的影响。第四部分针对疫情防治中暴露的公权力与私权利冲突的相关问题,提出化解权利冲突的对策。一是构建生命健康至上原则、公共安全保障原则、比例原则、伦理原则以及权利义务一致原则相结合的权利冲突协调规则;二是强化法定传染病防治法律保障,完善突发事件专门立法并细化应急措施,合理配置医患权利义务;三是提升突发传染病应急法治能力,强化疫情信息共享的预警防控能力与疫情信息监管体系;四是筑牢权利保障司法监督屏障,健全传染病疫情期间权利保障与侵权救济体系,明确权力对权利的限制及其限度;五是重塑个人与社会责任,提升医护人员职业技能与素养、畅通医患沟通渠道、拓宽相关主体的法律、道德与伦理教育。