本文从科技政策协调创新的视角出发，基于1998-2010年的面板数据，并把12年的数据划分为3个连续的时间周期，对中国区域27个省份各地区的创新效率进行实证分析。本文把区域创新系统过程分解为两个连续子过程-技术研究与发展过程和技术商业化过程，并使用超效率数据包络分析模型和协同度测算模型对中国区域创新系统的创新效率进行了系统的研究测度，在此基础上，对整个创新系统进行收敛检验。研究结果表明，我国区域创新系统的绩效整体呈现上升趋势，但是各地区发展差异较大，呈现不同的特点，政策绩效还有待提升。我国整体创新系统效率仍处于较低水平，从技术研究与发展阶段到技术商业化阶段的整个创新过程，只有13个区域位于最近创新实践前沿面上。同时，大多数区域的技术研究能力与技术商业化能力协同度低下，存在显著的不协调，特别是技术商业能力需要进一步得到发展。最后，通过构建区域技术协调创新机制，提出相应政策建议，重视区域技术商业能力发展，推进区域创新城市带的建设。