大科学工程的建设不仅是我国综合国力日益提高的体现,也对我国科学研究技术的进步和发展起到极大的促进作用,具有广泛的社会影响意义。对于国家的科学工程而言,提高项目管理水平是十分有必要的。而对于我国企业的科研项目而言,企业技术创新能力与发达国家还有明显差距。因此,对我国大科学工程与企业的技术创新项目效率评价的研究显得尤为重要。本研究分别针对国家科学工程与企业技术创新项目,基于系统化创新理论TRIZ对科研院所与科技型企业的技术创新管理模式进行分析。针对企业技术创新项目,结合TRIZ理论与DEA,从流程管理的视角综合系统、子系统以及超系统的要求构建评价指标并给出主观赋权与客观赋权集成的评价方法,从而精简提炼评价信息,建立四象限决策图,实现效率评价与指标权重的优化。针对国家科学工程建设项目,综合考虑项目进度与成本等绩效指标,提出国防建设项目效率评价方法。首先分析项目层与产品层的效能指标,然后构建项目管理绩效、科研能力和可靠性等七项指标的两层次系统动力学仿真模型,并基于DEA进行项目效率的评价。分别科技型、高端装备制造业、纺织业的三家主导型企业以及大科学工程建设项目为例,评价项目效率,验证项目效率动态建模思路与方法的正确性,用这两种方法进行评价分析和决策,并对这两种方法进行总结。本研究提出的项目效率的建模与评价方法,包含了多种项目效率的关键影响因素,为所建立的数据包络分析模型的不可测变量提供仿真值,有效解决项目效率评价模型中不可测变量的量化难题。同时,通过对这两种项目效率进行评价,对项目管理能力的提升具有实际指导意义和借鉴作用。