HIV-P24核酸适配体的筛选

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核酸适配体是通过SELEX技术筛选得到的一类寡核苷酸分子,能与靶分子强特异、高亲和力地结合,并发挥生物学效应。由于其具有靶分子范围广、分子质量小、免疫原性低、易于化学合成、改造和标记等优点,核酸适配体在临床诊断和疾病治疗领域中显现出重要的应用价值。P24蛋白是1型人类免疫缺陷病毒(HIV-1)的核心抗原,可作为HIV感染窗口期检测的血清标志物,血液中P24的测定在临床医学中也是艾滋病病情监控的一个重要指标。本课题利用SELEX技术筛选HIV-P24特异性核酸适配体,为建立核酸适配体辅助的P24检测方法奠定基础,对艾滋病的诊断和治疗具有重要意义。在本实验中,我们以重组HIV-P24为特异靶标,利用消减SELEX的策略从随机寡核苷酸库中筛选能与P24结合的寡核苷酸,并通过凝胶阻滞实验(EMSA)验证筛选到的次级库寡核苷酸与P24的结合。通过酶切、连接反应,将已获得的与P24结合的次级库寡核苷酸与载体pMD18-T构建成重组质粒,然后转化大肠杆菌JM-109形成单克隆以分离不同序列的寡核苷酸。利用不对称PCR制备寡核苷酸ssDNA,通过斑点杂交实验(Dot-blot)筛选与P24强结合的寡核苷酸,并检测核酸适配体识别P24的特异性。经过12轮的SELEX筛选,获得了针对HIV-P24富集的次级寡核苷酸库。凝胶阻滞实验显示,筛选到的寡核苷酸与P24结合。Dot-blot筛选到7条与P24有较强结合能力的寡核苷酸。特异性检测显示,18和27号适配体只与P24特异性结合,与人血清白蛋白、牛血清白蛋白和脱脂奶粉均不结合。本研究成功筛选到2个特异性识别和结合HIV-P24的核酸适配体,这为核酸适配体用于HIV-P24检测提供了一定的实验基础。
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