通过形态学与分子生物学分析方法，对我国沿海三疣梭子蟹(Portunus trituberculatus)渤海的黄骅(HH)、潍坊(WF)，黄海的青岛(QD)、连云港(LY)，东海的象山(XS)、莆田(PT)，南海的南澳(NA)、湛江(ZJ)、乌石(WS)合计9个群体进行了比较研究，分析9个群体三疣梭子蟹的遗传多样性和亲缘关系。 运用聚类分析，主成分分析和判别分析三种多元分析方法，采用9项形态比例参数，对我国沿海三疣梭子蟹9个野生群体的形态差异进行了比较。聚类分析结果表明，渤海、黄海、东海6个群体先聚到一起，再与南海的南澳和乌石群体聚到一起，南海的湛江群体在系统树的最外层，这说明渤海、黄海、东海6个群体三疣梭子蟹的形态差异较小，而与距其地理位置较远的南海3个群体的形态差异较大。主成分分析结果表明，总方差的贡献率分别是主成分1为37.00％，主成分2为26.70％，主成分3为10.53％，主成分4为7.72％，累积贡献率为81.95％。判别分析结果表明，三疣梭子蟹9个群体的形态存在一定的差异，判别准确率P1为37.50％—100.00％，判别准确率P2为57.14％—100.00％，判别效果依次为湛江群体>黄骅群体>南澳群体>莆田群体>潍坊群体>连云港群体>青岛群体>象山群体>乌石群体，综合判别率为74.83％。 通过对我国沿海三疣梭子蟹9个野生群体线粒体DNA控制区(putative control region，CR)基因片段和细胞色素氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ)基因片段进行扩增和测序，分别得到长度为530 bp和584 bp的片段。分析结果表明：CR 83条序列A+T平均含量为73.2％，共检测到91个变异位点，83个个体具有66种单倍型(haplotype)；COⅠ94条序列A+T平均含量为62.2％，共检测到34个变异位点，94个个体具有34种单倍型(haplotype)。对9个群体用MEGA 3.1构建NJ分子树，聚类结果显示，黄海、东海、渤海6个群体之间的相对遗传距离比较近，聚为一大支，南海3个群体相对遗传距离比较近，聚为一大支。AMOVA分析表明，群体间的遗传分化指数(Fst为—O．0745～O．2709，其中部分群体间达到显著差异(P<0.05)与极显著差异(P<0.01)，说明我国三疣梭子蟹不同野生群体间存在一定遗传分化。 利用新型分子标记SRAP(Sequence-related amplified pol ymorphism)对我国沿海三疣梭子蟹4个野生群体(青岛群体、连云港群体，象山群体、莆田群体)进行遗传多样性研究，从不同引物组合中筛选出8组条带清晰、多态性较丰富的引物组合，每对引物组检测到的位点数为3-8个，青岛、连云港，象山和莆田4个群体多态位点比例分别为52.38％、50.00％、42.86％、50.00％，平均杂合度分别为0.1827、0.1648、0.1515、0.1754。用Popgene 3.2软件依据扩增结果进行了遗传相似性度和遗传距离分析，并构建了分子系统树，结果表明象山群体和莆田群体间的遗传距离最小为0.0081，而象山群体和青岛群体间的遗传距离最大为0.0214。