2006年新《国际卫生条例》开始正式实施至今已有5年。这是在原来的《国际卫生条例》的基础上，由世界卫生组织(WHO)及其成员国历时10年修订而成的。新条例将原条例中的3种检疫传染病即鼠疫、霍乱、黄热病扩展为国际关注的公共卫生突发事件，并包括了生物、化学、核放射所引起的三件事，涉及范围更为广泛，防控的难度也相应加大，给作为《国际卫生条例(2005)》规定的口岸卫生“主管当局”的检验检疫部门提出了更高的要求，我国口岸卫生检疫工作面临重大的压力和严峻的挑战。同时，新的传染病不断出现，而过去已经控制的传染病又卷土重来。再加上我国地广人多，经济和社会发展水平不平衡，卫生医疗水平还较低;而且由于我国边境线漫长，受周边接壤国家疫情严重的影响，突发公共卫生事件经常发生。新的形势对国境口岸突发公共卫生事件应急机制提出了新的要求。作为社会管理和公共服务的职能机构，建立健全突发公共卫生事件应急机制，有效预防、及时控制和快速消除突发公共卫生事件的危害，保障人民群众的身体健康和生命安全，维护社会稳定和经济秩序，是检验检疫部门的一项重要任务。　　本文从公共职能危机管理的角度系统地分析国境口岸应急机制的现状，同时借鉴美国、英国、日本等国家应急机制中的先进经验，并结合检验检疫机构应急预案及应急处理程序等实际，系统地研究其在法制基础、组织体制、运作机制和应急保障系统等方面存在的不足，并从进一步完善应急法律体系、健全监测和预警机制、建立长效培训机制、建立国内国际间的协作机制、提升应急处置保障能力等五个方面提出相应的对策，以提高检验检疫部门在国境口岸的应急能力，更好地保障国家及人民的健康、安全，维护社会经济的稳定发展。