紫貂的微卫星筛选及种群遗传学研究

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紫貂(Martes zibellina)是一种非常珍贵的毛皮动物,曾是一种广泛分布的物种。由于受到长期盗猎和生境破碎化的影响,其野外种群数量波动较大,尤其是在我国,紫貂早已被列为濒危物种。在打击野生动物非法盗猎时,涉案的野生动物个体数是法院量刑的标准之一。微卫星技术由于具有突变速率快、多态性高等特性,已经被广泛应用于生物遗传作图、种群遗传研究、个体亲缘关系鉴定等方面。本研究从紫貂亲缘物种石貂(M.foina)、美洲貂(M.americana)和水貂(M.vison)已报道的微卫星引物中选取了33对引物,经过PCR扩增、毛细管电泳获取基因型和等位基因的克隆测序,最终得到了12个有效的微卫星位点(Mf1.11、Mf1.18、Mf2.13、Mf3.7、Mf4.10、Mf8.7、Mf8.8、Ma1、 Ma2、Ma15、 Mvi1354、Mvi2243)。利用这12个位点对99个紫貂样本(俄罗斯远东地区的48个,俄罗斯乌拉尔地区20个,我国小兴安岭林区31个)紫貂个体进行了种群遗传学的研究。结果显示,12个位点在99个紫貂群体中的观察等位基因数介于5-17个之间,平均等位基因数为9.83个。位点Mf8.8、Ma1、Mf4.10、Mvi2243和Mvi1354多态性较高,观察到10个以上的等位基因;位点Mf3.7和Ma15多态性最低,仅分别观察到7个和5个等位基因。12个位点多态信息含量介于0.314-0.890之间。所有位点的多态性都是高度多态(PIC≥0.5)或者中度多态(0.25≤PIC≤0.5)。Genepop计算结果显示,Mf2.13、Mf3.7、Ma2、Mvi1354、Mf4.10、Ma15和Mvi2243共7个位点符合Hardy-weiberg平衡。12个位点的联合P(ID)值显示这些位点的联合区分率很高,即使是在出现双胞胎的情况下,位点的错判率P(sib)也只有0.00002085。利用这12个位点对来自伊春市公安局查没的一批紫貂样本进行了个体识别,结果显示这批样品来自16个不同的紫貂个体。计算了三个紫貂地理种群的基因分化系数Fst、基因流Nm、遗传距离Da,根据Da构建了种群和个体间的NJ系统发生树,结果显示每两两紫貂地理种群之间的基因分化都极显著(Fst=0.0443-0.1643),基因流Nm为1.2716-5.3933,遗传距离较远,其中又以远东地区的遗传距离与另外两个种群最远。
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