中国西部嗜碱芽胞杆菌资源的多样性

来源 :福州大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:Haroldzhang
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我国西部独特的地理气候特征和自然环境,使该地区蕴藏着丰富的嗜碱芽胞杆菌资源样本,为嗜碱芽胞杆菌的分离和系统分类方面的研究提供了得天独厚的条件。本研究以四川、云南、西藏、青海、新疆、甘肃、宁夏等7个省份表层土壤样本(0~15 cm)为研究对象,采用可培养法分离土壤中的嗜碱芽胞杆菌资源,并对潜在新种进行多相分类研究。从中分离纯化获得嗜碱芽胞杆菌751株,16SrRNA基因序列鉴定为12个属的108个种,其中有35株菌与其最近模式菌的16S rRNA基因序列的相似性都小于98%,为潜在新种。7个省份土壤样本中的嗜碱芽胞杆菌种属分布特征差异较大,但每个地区都以芽胞杆菌属(Bacillus)为优势属。西部地区嗜碱芽胞杆菌资源的多样性指数Shannon(H’)的次序是新疆>宁夏>青海>四川>云南>西藏>甘肃。采用多相分类技术对其中的5株潜在新种资源进行了分类地位的确定。研究结果表明:菌株FJAT-45037T好氧,芽胞呈卵圆形,以周生鞭毛运动。生长的温度范围是10~35℃(最适30℃)、pH范围是7.5~12.0(最适pH 9.0~10.0)和盐度范围是0~12%(最适4%)。脂肪酸主要成分是anteiso-C15:0和anteiso-C17:0;醌组分为MK-6和MK-7;细胞壁的特征氨基酸组分是meso-DAP;极性脂组分主要是DPG、PG和PE。菌株FJAT-45037T 与其最相近模式菌株Bacillus marmarensis GMBE 72T 的 16S rRNA 基因序列相似性达97.67%,DNA-DNA杂交(isDDH)同源性为18.6%,平均核苷酸一致性(ANI)为84.46%,DNAG+C含量为39.79 mol%。综合多相研究结果,表明菌株FJAT-45037T是芽胞杆菌属的新种,命名为Bacillus alkalisalsus sp.nov.,模式菌株为FJAT-45037T(= DSM 104053T= CCTCC AB 2016229T)。菌株FJAT-45086T好氧,芽胞呈卵圆形,以端生鞭毛运动。生长的温度范围是15~35℃(最适30℃、pH范围是6.0~12.0(最适pH9.0)和盐度范围是0~10%(最适4%)。脂肪酸主要成分是anteiso-C15:0和C16:0;醌组分是MK-7;细胞壁的特征氨基酸组分是meso-DAP;极性脂组分主要是DPG、PE、PG及PC。菌株FJAT-45086T与其最相近模式菌株Bacillus hemicellulosilyticus JCM 9152T的16S rRNA基因序列相似性达 96.68%,isDDH 同源性为 22.7%,ANI 为 84.79%,DNA G+C 含量为 37.81 mol%。综合多相研究结果,表明菌株FJAT-45086T为芽胞杆菌属的新种,命名为Bacillus alkalisoli sp.nov.,模式菌株为FJAT-45086T(=DSM 104056T=CCTCCAB2016232T)。菌株FJAT-45122T兼性厌氧,芽胞呈卵圆形,以端生鞭毛运动。生长的温度范围是10~40℃(最适30℃)、pH范围是7.5~12.0(最适pH 9.0)和盐度范围0~10%(最适 4%)。脂肪酸主要成分是 iso-C15:0、anteiso-Cis:0、iso-C17:0、anteiso-C17:0和iso-C17:1ω10c;醌组分为MK-7;细胞壁的特征氨基酸组分为meso-DAP;极性脂组分主要是DPG、PME 和 PG。菌株 FJAT-45122T 与其最相近模式菌株 Bacillus abyssalis DSM 25875T的16S rRNA基因序列相似性达95.87%,isDDH同源性为27.5%,ANI值为68.69%,DNA G+C含量为36.11 mol%。综合多相研究结果,表明菌株FJAT-45122T为芽胞杆菌属的新种,命名为Bacillus alkalisoli sp.nov.,模式菌株为FJAT-45122T(= DSM 104631T=CCTCCAB2016254T)。菌株FJAT-45347T好氧,芽胞呈椭圆形,无鞭毛着生。生长的温度范围是15~35℃(最适20℃)、pH范围是7.5~12.0(最适pH 8.0)和盐度范围0~20%(最适8%)。脂肪酸主要成分是anteiso-C15:0和anteiso-C17:0;醌组分为MK-7;细胞壁的特征氨基酸组分为meso-DAP;极性脂组分主要为DPG、PE和PG。菌株FJAT-45347T与其最相近模式菌株Bacillus clarkiiDSM 8720T的16S rRNA基因序列相似性达96.1%,isDDH 同源性为 26.2%,ANI 值为 68.47%,DNAG+C 含量为 40.62 mol%综合多相研究结果,表明菌株FJAT-45347T为芽胞杆菌属的新种,命名为Bacillus populi sp.nov.,模式菌株为 FJAT-45347T(=DSM 104632T=CCTCCAB2016257T)。菌株FJAT-45385T兼性厌氧,芽胞端生呈椭圆形,以周生鞭毛运动。生长的温度范围是20~40℃(最适30℃)、pH范围是7.0~11.0(最适pH 9.0)和盐度范围0~10%(最适 4~6%)。脂肪酸主要成分为 anteiso-C15:0、iso-C15:0和C16:0;醌组分为 MK-7;细胞壁的特征氨基酸组分为meso-DAP;极性脂组分主要为DPG、PE和PG。菌株FJAT-45385T与其最相近模式菌株Bacillus wakoensis N-1T的16S rRNA基因序列相似性达 96.01%,isDDH 同源性为 18.9%,ANI 值为 70.3%,DNA G+C 含量为 38.13 mol%。综合多相研究结果,表明菌株FJAT-45385T为芽胞杆菌属的新种,命名为Bacillus urbisdiabolisp.nov.,模式菌株为 FJAT-45385T(= DSM 104651T= CCTCC AB 2016263T)。
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