论文部分内容阅读
目的:(1)探讨LncRNA-GAS5基因rs145204276 I>D、rs2235095 G>A、rs1951625G>A、rs2067079 C>T和rs6790 G>A 5个SNPs位点与系统性红斑狼疮的遗传易感性的关系。(2)检测SLE组和健康对照组外周血单个核细胞中LncRNA-GAS5基因的表达水平,并分析其多态性与LncRNA-GAS5基因表达水平的关系。(3)探讨THP-1细胞中LncRNA-GAS5/miR-221-3p/PTPN3之间的靶向调控关系。方法:(1)选取302例系统性红斑狼疮患者(SLE组)和396例健康对照者(对照组)作为研究对象,采用SNPscan技术和DNA测序技术对LncRNA-GAS5基因rs145204276 I>D、rs2235095 G>A、rs1951625 G>A、rs2067079 C>T和rs6790 G>A五个SNPs位点进行基因分型检测。(2)统计分析rs145204276 I>D多态性与SLE患者临床特征之间的关系。(3)采用在线软件SHEsis分析两组间连锁不平衡及单倍型分布情况。(4)采用qRT-PCR检测SLE组和健康对照组(各45例)外周血单个核细胞中的LncRNAGAS5表达水平,分析LncRNA-GAS5 rs145204276不同基因型在SLE组中的表达水平,探讨基因突变表达调控的功能。(5)分别构建LncRNA-GAS5和PTPN3基因的野生型/突变型重组质粒,转染239T细胞,采用双荧光素酶报告验证LncRNA-GAS5与miR-221-3p,miR-221-3p与PTPN3的靶向调控关系。(6)分别构建过表达和敲低LncRNAGAS5慢病毒质粒,转染THP-1细胞,细胞培养并收集后,采用qRT-PCR检测LncRNAGAS5、miR-221-3p和PTPN3基因的表达水平,Western blot技术检测PTPN3的蛋白水平。(7)分别构建敲低LncRNA-GAS5慢病毒质粒,过表达PTPN3慢病毒质粒以及miR-221-3p inhibitor,转染THP-1细胞,细胞培养并收集后,采用qRT-PCR检测miR-221-3p和PTPN3基因的表达水平,Western blot技术检测PTPN3蛋白水平。结果:(1)LncRNA-GAS5基因rs145204276 I>D、rs2235095 G>A、rs1951625 G>A、rs2067079 C>T和rs6790 G>A五个SNPs位点在SLE患者和健康对照者中均存在多态性。其中rs145204276 I>D位点多态性在SLE组和健康对照组之间比较,差异具有统计学意义,与I/I基因型相比较,I/D和D/D基因型以及显性模型I/D+D/D均具有降低SLE的发病风险(I/D vs.I/I:OR=0.627,95%CI,0.46-0.87,P=0.004;D/D vs.I/I:OR=0.541,95%CI,0.30-0.98,P=0.041;I/D+D/D vs.II:OR=0.611,95%CI,0.45-0.83,P=0.002);与I等位基因相比较,D等位基因显著降低SLE的发病风险(D vs.I:OR=0.674,95%CI,0.53-0.86,P=0.002)。然而,rs2235095 G>A、rs1951625 G>A、rs2067079 C>T和rs6790G>A位点多态性在SLE组和健康对照组之间比较,差异无统计学意义(P>0.05)。(2)rs145204276 I>D位点I/D+D/D基因型和D等位基因分布频率与狼疮性肾炎相关(I/D+D/D vs.II:OR=0.57,95%CI,0.36-0.92,P=0.020;D vs.I:OR=0.63,95%CI,0.43-0.93,P=0.019)。(3)单倍型分析结果显示,A-A-C-G-D单倍型在SLE组和健康对照组间的分布差异存在统计学意义(OR=0.67,95%CI,0.49-0.91,P=0.010)。(4)SLE患者外周血单个核细胞中LncRNA-GAS5基因表达水平显著低于健康对照者,差异具有统计学意义(P<0.001),进一步分析发现,SLE组中携带D等位基因的患者LncRNA-GAS5基因表达水平显著高于携带I等位基因的患者。(5)双荧光素酶报告试验结果显示,LncRNA-GAS5(WT)+miRNA-221-3p mimics组荧光素酶活性显著低于LncRNAGAS5(WT)+miRNA-221-3p-NC组,差异具有统计学意义(P<0.001),而LncRNAGAS5(MT)+miRNA-221-3p mimics组与LncRNA-GAS5(MT)+miRNA-221-3p-NC组的荧光素酶活性相比较,差异无统计学意义(P=0.201);PTPN3(WT)+miRNA-221-3p mimics组荧光素酶活性显著低于PTPN3(WT)+miRNA-221-3p-NC组,差异具有统计学意义(P<0.001),而PTPN3(MT)+miRNA-221-3p mimics组与PTPN3(MT)+miRNA-221-3p-NC组的荧光素酶活性相比较,差异无统计学意义(P=0.198)。(6)敲低LncRNAGAS5慢病毒感染THP-1细胞后,miR-221-3p的表达水平上升2.977倍,PTPN3的表达水平下降0.510倍。过表达LncRNA-GAS5慢病毒感染THP-1细胞后,miR-221-3p的表达水平下降0.657倍,PTPN3的表达水平上升1.926倍。(7)敲低LncRNA-GAS5+miR-221-3p inhibitor慢病毒感染THP-1细胞后,qRT-PCR结果显示,miR-221-3p的表达水平下降0.473倍,PTPN3的表达水平上升1.491倍。敲低LncRNA-GAS5+PTPN3-OE慢病毒感染THP-1细胞后,qRT-PCR结果显示,miR-221-3p的表达水平下降0.710倍,PTPN3的表达水平上升14.511倍。结论:(1)LncRNA-GAS5基因rs145204276 I>D位点多态性可能与SLE遗传易感性相关。I/D、D/D基因型、显性模型I/D+D/D以及D等位基因可降低SLE发病风险和狼疮性肾炎的概率。单倍型A-A-C-G-D可降低SLE的发病风险。(2)SLE患者外周血单个核细胞中LncRNA-GAS5基因表达水平显著低于健康对照者,其可能是SLE潜在的生物学标志物或治疗靶标。(3)LncRNA-GAS5为miR-221-3p调控基因,而PTPN3是miR-221-3p的下游靶蛋白。(4)敲低LncRNA-GAS5,可促进miR-221-3p表达,而抑制PTPN3表达;过表达LncRNA-GAS5,可抑制miR-221-3p表达,而促进PTPN3表达。总之,LncRNA-GAS5可能通过竞争性结合miR-221-3p靶向调控PTPN3表达,从而促进SLE的发生。