【摘 要】
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COVID-19疫情已然成为近年来最受各国政府、人民群众和科研人员关注的公共卫生话题。全球范围内不断上升的确诊病例数加剧了世界各地人们愈发强烈的担忧。在相关研究中,基于流行病学模型的疫情曲线解释性分析和预测问题是数据科学和统计学者所重点关注的主题。相较于历史上的诸多大流行病,COVID-19具有更强大的持续传播能力,并且在大规模抑制措施和疫苗接种背景下、其发展趋势仍然极富变化和不确定性;这些特性也
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COVID-19疫情已然成为近年来最受各国政府、人民群众和科研人员关注的公共卫生话题。全球范围内不断上升的确诊病例数加剧了世界各地人们愈发强烈的担忧。在相关研究中,基于流行病学模型的疫情曲线解释性分析和预测问题是数据科学和统计学者所重点关注的主题。相较于历史上的诸多大流行病,COVID-19具有更强大的持续传播能力,并且在大规模抑制措施和疫苗接种背景下、其发展趋势仍然极富变化和不确定性;这些特性也对于COVID-19疫情曲线的流行病学建模分析提出了前所未有的挑战。本研究针对不同阶段和不同研究范围的疫情曲线,逐步提出了三种由数据驱动、基于统计学方法的建模设计。在第一部分研究中,对于多个疫情中心国家的第一波疫情,我们构建了一个基于三模块的整合模型框架:一是通过非线性成长模型(Zhao等,2019)估计主要流行病学参数,二是运用一个基于泊松增量的疫情统计模型(Lin等,2020)实现对于病毒传染周期的估计,三是引用Maier&Brockmann(2020)提出的SIRX动力学房室模型对疫情曲线进行拟合和预测。创新的整合模型设计不仅有助于实现对于感兴趣变量的模块化估计,也从一定程度上减少了常用流行病学模型对于参数预设值的强烈依赖性。我们基于33个疫情中心国家的病例统计数据对疫情初期的增长曲线进行模型拟合、流行病学参数的估计以及短期疫情曲线的预测(也包括一些具有解释性的特征,如疫情顶峰、稳定日期、最终规模等),其实证结果基本与实际增长趋势相符,同时也凸显了实行有效的抑制政策和隔离措施对于平缓疫情曲线的重要性。第二部分研究则针对一个典型国家的长期多波段疫情。相较于第一波疫情增长曲线的拟合与预测,对长期疫情的流行病学分析则需要解释更多复杂的问题,包括多波段曲线以及大规模疫苗接种因素。在这一部分的研究中,我们采用了疫苗接种实时人数的经验数据,创新地提出了一个扩展版的分段SEIR模型、并结合贝叶斯模型框架实现精确而高效的参数推断。我们首次基于以色列的日增病例统计进行了长期疫情的实证研究,结果显示了良好的长期拟合效果和短期预测能力,尤其对于多波段变化点的估计与现实发生的转折事件基本吻合;另外该研究也部分反映出不同阶段的抑制政策以及疫苗接种对于控制疫情传播的差异效果。然而,传统贝叶斯框架在处理大量模型参数的推断问题时、存在一些瓶颈;另外随着多个变种病毒的接连蔓延所带来的全新疫情发展趋势,我们用于解释分析的流行病学模型也需要进一步的改进设计。因此在第三部分研究中,将着重增加对于变种病毒疫情的解释,我们创新地建立了独特的混合模型结构以探索变种病毒侵入与扩散的流行病学传播过程,同时基于一个有效的神经网络框架(Radev等,2020a)克服了传统贝叶斯推断中所遇到的似然函数无法解析表示等技术阻碍。与前一部分研究的客观条件类似,我们结合最新数据、同样通过分析以色列的完整多波段疫情曲线来验证该方法的解释性和适用性。实证研究展示了该模型框架达到了高精度和高性能的参数估计与模型预测效果,并且混合模型结构非常有助于刻画出变种病毒的演变过程。综合而论,本文中的三部分研究内容,对于不同阶段及各研究对象的疫情曲线均取得了良好的解释性分析和预测效果。尽管建模方法不同,但三部分的研究主题循序渐进,通过持续的创新改进设计并融合应用了多种统计学和深度学习的技术方法、逐步解决了之前研究所存在的缺陷与限制。
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