半胱氨酸二肽与三肽分子在ABEEMσπ/MM力场中稳定构象的研究

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天然氨基酸在生物体内有着重要的生理作用,生物中的天然氨基酸往往以某些特定的稳定结构存在于自然条件下,因此探究天然氨基酸多肽分子的构象是具有非常重要意义的。本文应用浮动电荷极化力场ABEEMσπ/MM,以天然氨基酸中半胱氨酸二肽、三肽模型分子为例对其稳定构象进行探究。首先运用B3LYP/6-311++G(d,p)高水平从头算对势能面扫描,得到二维、三维扫描图像,从而得到所有能量极小值点的结构。通过进一步的优化和频率计算,可以获得半胱氨酸二肽共十六类稳定构象。浮动电荷力场ABEEMσπ/MM同样可以获得
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