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为了提高山羊繁殖性能,以增加山羊规模化生产的经济效益,为高繁殖力山羊标记辅助育种提供基础材料,以黄淮山羊的安徽地方类群(安徽白山羊)不同繁殖率群体为试验对象,进行了扩增片断长度多态性(AFLP,amplified fragment length polymorphism)分析.试验设计了8条EcoRⅠ和8条TaqⅠ引物,共计64对引物组合,采集了10只高繁殖性能(连续3胎,每胎产4羔以上)的多胎安徽白山羊和10只低繁殖性能(连续3胎,每胎只产1羔)的安徽白山羊的耳组织样,构建了代表安徽白山羊高繁殖力和低繁殖力的两个池DNA,利用AFLP技术分析了安徽白山羊两个极端群体DNA水平的差异,以期获得与安徽白山羊多胎性能相关的分子标记,并通过这些分子遗传标记加快多胎安徽白山羊的选育进展,为安徽白山羊的进一步选育提供一定的理论依据.研究结果表明,AFLP技术适用于山羊基因组DNA的差异分析。实验AFLP图谱条带清晰、丰富,共获得32条差异片段,其中阳性差异片段24条,阴性差异片段8条。选择其中差异条带多、清晰的引物组合12对进行了重复实验,所获得的差异条带经过回收、TA克隆测序获得两条差异条带的序列信息,一条序列长374bp,另一条序列长254bp。所获得的两条差异条带序列经比对后发现374bp的序列存在同源序列,而254bp的序列没有同源序列.为验证AFLP分析所获得的序列能否作为安徽白山羊多胎性能的分子标记,实验根据比对结果针对374bp的序列,重新设计引物,并进行了PCR-RFLP分析验正。实验采集了104只安徽白山羊耳组织样,其中高产群12只,低产群14只,普通群78只。结果在安徽白山羊群体中发现两种基因型,其中AA型12只,AB型92只,没有发现BB型.高产群、低产群和普通群的AB基因型频率、AA基因型频率分别为0.9167,0.7123,0.9103和0.0833,0.2857,0.0897。高产群和普通群的AA基因型频率都比相应的低产群要低,可推测等位基因B对安徽白山羊高繁殖性能有正向作用,而A基因对安徽白山羊的繁殖性能有负向效应。