【摘 要】
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目的:含蒽环类药物化疗方案所致肝损伤(anthracycline-induced liver injury,AILI)是乳腺癌术后辅助化疗的严重并发症之一。外泌体作为细胞间通信的载体,在药物性肝损伤(drug-inducedliverinjury,DILI)中发挥重要作用。本研究探讨了外泌体内容物作为AILI标志物的潜力。方法:本研究共招募70名化疗后乳腺癌患者。在分离出血浆来源的外泌体后,使用R
【基金项目】
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中国医学科学院医学与健康科技创新工程(Grant No.2017-I2M-3-012&No.2017-I2M-1-013);
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目的:含蒽环类药物化疗方案所致肝损伤(anthracycline-induced liver injury,AILI)是乳腺癌术后辅助化疗的严重并发症之一。外泌体作为细胞间通信的载体,在药物性肝损伤(drug-inducedliverinjury,DILI)中发挥重要作用。本研究探讨了外泌体内容物作为AILI标志物的潜力。方法:本研究共招募70名化疗后乳腺癌患者。在分离出血浆来源的外泌体后,使用RNA测序揭示外泌体mRNA、circRNA和miRNA表达谱,并对非肝损伤组和肝损伤组进行基因差异表达分析。在mRNA的研究中,使用DAVID数据库对差异表达的mRNA进行GO和KEGG富集分析。使用STRING数据库建立差异表达mRNA的蛋白-蛋白相互作用网络(PPI网络),并通过Cytoscape软件鉴定出在AILI中发挥重要作用的外泌体mRNA。在circRNA的研究中,qRT-PCR用于验证差异表达的circRNA。CircInteractome 数据库和 CSCD 数据库用于预测 circRNA 的靶miRNA,miRTarBase数据库用于检索miRNA的靶mRNA。靶mRNA与CTD数据库中的DILI相关基因取交集后,根据相互作用关系,构建circRNA-miRNA-mRNA调控网络。使用DAVID数据库对circRNA间接作用的mRNA进行GO和KEGG富集分析,以预测circRNA发挥的调控功能。在miRNA的研究中,使用miRTarBase和miRDB数据库预测差异表达miRNA的靶基因。靶基因与DILI相关基因的交集被定义为AILI相关靶基因。使用DAVID数据库对AILI相关靶基因进行GO和KEGG富集分析。使用STRING数据库建立AILI相关靶基因的PPI网络,通过Cytoscape软件鉴定出在AILI中发挥重要作用的外泌体miRNA。结果:非肝损伤组和肝损伤组间差异表达的mRNA有443个。富集分析结果显示,差异表达的mRNA显著富集于Notch信号通路、白细胞介素-10产生的正向调节、线粒体膜电位的调控、对活性氧的反应、铜离子结合、谷胱甘肽代谢、T细胞受体信号通路和细胞色素P450代谢异源物质等肝损伤相关通路。在PPI网络筛选出的10个hub基因中,ALB、KRT8和VEGFA是DILI相关基因。非肝损伤组和肝损伤组间差异表达的circRNA有34个。PCR结果显示,circ0005130和circ0094333在患者中的表达情况与测序结果一致。经生物信息学分析,共预测出13条circRNA-miRNA-mRNA调控网络,circRNA可能经这些途径参与调控细胞对有毒物质的反应、氧化还原过程等生物学功能。非肝损伤组和肝损伤组间差异表达的miRNA有30个,miRNA的AILI相关靶基因有79个。AILI相关靶基因在NOD样受体信号通路、HIF-1信号通路和FoxO信号通路中显著富集。在PPI网络中,IL-6和SOD2是最为重要的hub基因,可分别通过激活免疫反应和氧化应激反应参与AILI的发生发展。在miRNA-hub基因网络中,miR-1-3p可作用于多个hub基因,发挥重要调控作用。结论:ALB、KRT8、VEGFA、circ0005130、circ0094333、miR-1-3p 可能在 AILI中发挥重要功能,这些分子有潜力成为AILI诊断或预后预测的生物标志物。AILI的发病机制可能为氧化应激、抗氧化酶水平降低、线粒体功能障碍、炎症反应等生物学过程的激活。
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