炎症信号通路相关基因多态性与强直性脊柱炎的关联研究

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目的强直性脊柱炎(ankylosing spondylitis, AS)是一种慢性炎症性自身免疫疾病。以往研究证明其与细胞因子TNF-α和某些炎症相关因子关系密切。而A20和IL-12与TNF-α在功能上相关。通过炎症信号通路上相关的分子来进行疾病易感基因的关联研究已成为一种新的寻找疾病候选基因的方法。本研究通过选择基因A20上的3个SNPs和细胞因子IL-12通路上的IL12B、IL12RB2、JAK2、STAT3、STAT2、STAT4基因及其基因附近的15个SNPs,共18个SNPs组成的炎症信号通路进行病例-对照关联研究,寻找与AS相关的易感基因,探讨AS可能的遗传病因。方法采用新型基因分型方法HRM与传统的分型方法PCR-RFLP首先在吉林汉族人群中对筛选的18个SNPs进行56:56病例-对照研究,分析基因型,寻找阳性点。随后在宁夏汉族人群298名AS散发患者和339名对照中进行复制研究。结果(1)炎症信号通路上18个SNPs的基因型分析中仅见rs 610604与AS有关联(P=0.031),其余17个SNPs在吉林病例-对照研究中等位基因频率的分布差异无显著性,P值均>0.05。(2)5号染色体的单倍型分析: rs 17728338、rs 3212227、rs 3213094组成的单倍型GAG(P=0.02;OR=1.896,95% CI:1.102-3.264),rs 17728338、rs 6887695、rs 3212227组成的单倍型GGA(P=0.013;OR=2.016,95% CI:1.159-3.508),rs 6887695和rs 3212227组成的单倍型GA(P=0.03;OR=1.806,95% CI:1.056-3.090),rs 3212227、rs 3213094组成的单倍型AG(P=0.023;OR=1.852,95% CI:1.088-3.152)在吉林汉族人群病例和对照中分布具有显著性差异,且AS组携带这些单倍型的频率显著地高于对照组。5号染色体的正关联单倍型中,只有rs3212227野生型等位基因A一致性存在于这四个单倍型中,A可能是构成导致吉林人群中个体对AS易感的单倍型的主要等位基因。(3)A20基因的单倍型分析:rs 5029939、rs 2230926、rs 610604组成的单倍型CTC(P=0.039;OR=2.732,95% CI:1.019-7.323),rs 5029939和rs 610604组成的单倍型CC(P=0.039;OR=2.732,95% CI:1.019-7.323),rs 2230926和rs 610604组成的单倍型TC(P=0.025;OR=2.944,95% CI:1.107-7.830)在吉林汉族人群病例和对照中分布存在显著性差异,且AS组的携带率显著地高于对照组。在正关联单倍型中,只有rs 610604野生型等位基因C一致性存在于这三个单倍型中, C可能是构成导致吉林人群中个体对AS易感的单倍型的主要等位基因。(4)经过在宁夏汉族病例-对照中验证发现:rs 610604的CC基因型频率与AS有关联(2.68% vs 0.59%,P1/2=0.034),进一步经两人群组合分析,CC基因型得到与AS显著性关联的证明(Pjiont值=0.037)。结论(1)炎症信号通路上,5号染色体IL12B基因的rs 3212227、rs 3213094、rs6887695和rs 17728338组成的单倍型区域或其周围可能存在与AS真正关联的变异,在正关联单倍型中,rs3212227野生型等位基因A一致性存在于四个正关联单倍型中,A可能是构成导致吉林人群中个体对AS易感的单倍型的主要等位基因。(2)A20基因rs 5029939、rs 2230926、rs 610604组成的单倍型区域或其周围可能存在与AS真正关联的变异,在正关联单倍型中,只有rs 610604野生型等位基因C一致性存在于三个正关联单倍型中,C可能是构成导致吉林人群中个体对AS易感的单倍型的主要等位基因。(3)经两个群体的合并分析表明,rs 610604的CC基因型频率可能与AS易感性有显著性关联(Pjiont值=0.037)。
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