小花棘豆内生真菌Alternaria oxytropis OW7.8中swnH1基因的克隆及功能研究

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小花棘豆(Oxytropis glabra DC.)是豆科棘豆属(Oxytropis)的有毒植物。本课题组前期分离出小花棘豆内生真菌Alternaria oxytropis,可产生有毒吲哚兹啶类生物碱——苦马豆素(swainsonine,SW),SW导致动物细胞空泡变性和代谢功能紊乱,牲畜过量采食含SW的小花棘豆出现中毒现象,严重则导致死亡,从而危害了草原畜牧业发展。目前对A.oxytropis中SW合成的分子机制及代谢途径研究甚少,对其进行研究有重要的意义。本课题组前期发现酵母氨酸还原酶(saccharopine reductase,Sac)在A.oxytropis OW7.8的SW合成中起重要作用,其他参与SW合成各步反应的关键酶基因还未深入研究。在部分产SW的绿僵菌中,推测swnH1基因编码的2-酮戊二酸铁依赖性双加氧酶催化(1S,2S/R,8a S)1,2-二羟基吲哚里西啶生成SW。本研究首次在A.oxytropis OW7.8中克隆了swnH1基因及cDNA(Gen Bank accession number:ON416998),对其进行生物信息学分析。构建基因的敲除载体、过表达载体及基因编辑载体,将其转化A.oxytropis OW7.8原生质体,经再生培养筛选转化子,利用PCR及DNA测序进行验证。分析在A.oxytropis OW7.8中swnH1基因对SW合成的影响,为探索该真菌SW合成的分子机制及代谢途径提供基础数据。主要研究结果如下:1.根据A.oxytropis OW7.8基因组测序数据设计引物,利用PCR技术克隆了swnH1及cDNA序列,该基因的ORF为921 bp,预测编码306个氨基酸。基因序列起始密码子ATG至终止密码子TAG,全长987 bp,其中包含一个66 bp的内含子,内含子边界序列符合GT-AG法则。对SwnH1氨基酸序列进行生物信息学预测,其分子量为36377.78 Da,等电点为6.61,分子式为C1624H2568N444O476S14,编码亲水性蛋白,无信号肽和跨膜结构域,大概率定位于细胞质中。2.将A.oxytropis OW7.8接种至含不同浓度Hyg B(0.4μg/m L、0.5μg/m L、0.6μg/m L、0.7μg/m L、0.8μg/m L、0.9μg/m L、1μg/m L、2μg/m L、3μg/m L、4μg/m L、5μg/m L、10μg/m L、15μg/m L、20μg/m L)的PDA培养基上,发现当Hyg B浓度≥1μg/m L时,可完全抑制其生长,可依此筛选转化子。3.利用PCR技术扩增swnH1的上游同源臂(618 bp)、潮霉素磷酸转移酶基因(hygromycin phosphotransferase,hph)的5’端(764 bp)、hph 3’端(931 bp)和下游同源臂(322 bp)序列。采用Split-marker方法连接成swnH1基因敲除片段,并将其与p MDTM19-T载体连接,构建出swnH1的敲除载体(5008 bp)。4.扩增两端带Eco RⅠ和Bam HⅠ限制性酶切位点的swnH1的cDNA序列,用上述两种限制性酶对p BARGPE1-Hygro载体进行双酶切后,将两者连接,以Pgpd A为启动子,Ttrp C为终止子,构建出swnH1的过表达载体(7087 bp),将其转化OW7.8原生质体,筛选到一个过表达转化子swnH1-T1(Hyg B 2μg/m L),相比于野生型OW7.8其菌落形态有所不同,菌落为黑色呈松散的片状,生长速度缓慢。5.利用重叠PCR技术扩增swnH1基因的sg RNA表达盒,通过无缝克隆与p FC332载体进行连接,构建出swnH1基因的CRISPR-Cas9基因编辑载体(16510 bp),载体包含g RNA scaffold、Ampr、hph,启动子Pgpd A和终止子Ttrp C等元件。
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