宁夏4个绵羊群体繁殖相关基因SNP的检测与分析

来源 :宁夏大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:louqiangdj
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
宁夏优质肉羊新品种(系)培育中,多胎(羔)性状是重要的目标性状。由于繁殖性状遗传力较低,表型选择效果差。而采用分子标记辅助选择方法能够提高选择的准确性,加快选育进展。本研究采用候选基因飞行质谱法,选用与羊的繁殖性状相关的8种基因60个snp位点作为候选位点,对杜泊羊(D)、小尾寒羊(H)、滩羊(T)和滩寒杂交羊(TH)4个品种384例个体的多态性进行了检测,分析群体差异性,筛选多羔候选基因。结果表明:(1)BMPR1B基因的9个SNP位点中,5个位点无多态性,且在4个羊群中基因型相同;4个位点有多态性。rs418841713位点C基因频率在D、T与H、TH间差异极显著(P<0.01),且D与T、H与TH间差异显著(0.01<P<0.05);rs428753381位点T基因频率在T群中极显著高于D、H、TH群体(P<0.01);rs603752979位点T基因频率在D中极显著高于T、H、TH群体(p<0.01);BMPR1B746位点G基因频率在D、T与H、TH群体间存在极显著差异(P<0.01)。(2)BMP15基因4个SNP位点、ESR1基因2个SNP位点、PGR基因7个SNP位点和在D、H、T、TH4个羊群中没有多态性,基因型无差异。GnRH基因3个SNP位点在这4个群体内没有显著差异(p>0.05)。(3)在LHR基因15个位点中,5个SNP位点没有多态性,10个位点有多态性,但7个位点在4个群体中无显著差异(p>0.05),3个位点在4个群体中有差异。rs422326439位点A基因频率在D群体极显著高于T、TH(p<0.01);rs410734874位点A基因频率在T、TH群体极显著高于 D、H 群体(p<0.01)。(4)ESR2基因10个SNP位点中,3个没有多态性;7个位点有多态性,但4个位点基因频率在4个群体中不差异显著(P>0.05);3个位点有多态性,rs405617034、rs428438934在D、H和TH中A基因频率极显著高于滩羊(P<0.01);rs603897979位点T基因频率在D群中极显著高于H、T、TH(P<0.01)。(5)FSHR基因9个SNP中,4个多态性很低,且在4个群体间无差异性;rs399253678位点多态性较高,但4个群体中不存在显著差异(P>0.05);rs399612350位点A基因频率在T与D、H、TH群体间存在极显著差异(P<0.01);rs422112895位点G基因频率在T与H、TH、D群体间存在极显著差异(P<0.01);rs398233545和rs1093458544位点T基因频率在D与T、H、TH群体间存在极显著差异(P<0.01)。(6)在3号染色体上发现2个连锁群,第一个连锁群是FSHR基因的rs422112895和rs398233545两位点,有TC、GT两种单倍型,TC频率高于GT;第二个连锁群LHR基因的422326439、398733991、421442316 和 410734874 四个位点或 rs422326439、rs398733991、rs421442316、rs401906902和rs410734874五个位点连锁,分别形成5或6个单倍型,CCAA或CCAAA频率最高。7号染色体发现1个连锁群,是ESR2基因的405617034和4284389434两个位点连锁,形成GT和AC两种单倍型,GT频率高于AC。初步确定:BMPR1B 基因的 4 个位点(rs418841713、rs428753381、rs603752979和BMPR1B746)、ESR2 基因的 rs603897979 位点和 FSHR 基因的 3 个位点(rs399612350、rs398233545 和rs1093458544)可作为4个群体的多羔基因检测的候选基因。
其他文献
探讨葛根(Pueraria lobata(Willd.)Ohwi)的乙醇提取物对糖尿病肾病肾功能的保护作用,通过腹腔注射氯化镉联合高脂高糖饲料喂养的诱导方式构建糖尿病肾病小鼠模型,保护组灌胃
目的: 研究托瑞米芬(TOR)对人肺腺癌细胞株A549的毒性作用及其与去甲长春花碱(NVB)联用的协同效应并探讨其可能的机制,为提高肺癌的化疗疗效提供新方法。 方法: 人肺腺
在阐述互联网环境下推进高职院校会计人才培养模式改革与创新的必要性基础上,对互联网环境下的高职院校会计学人才培养模式优化策略进行探索。
目的:观察并评价温肺止流丹加减治疗脾肺气虚型鼻渊的临床疗效。方法:随机抽取58例我院耳鼻喉科近年诊治的脾肺气虚型鼻渊患者作为观察对象,其中29例分为观察组,以温肺止流丹为基
十堰地区因其地层岩性、地质构造等地质的复杂性及强降雨、人类工程活动等外部触发因素,目前发育的滑坡等地质灾害越来越多.本文将以谷竹高速公路某滑坡为例,通过现场调查、
采用离线分析法和在线分析法同步监测了武汉市PM2.5中有机碳(OC)、元素碳(EC)和总碳(TC)的浓度,分析了2种方法的差别。结果表明,离线分析法与在线分析法对TC的测定结果具有很
为了提高混沌加密系统的保密性能,需要设计具有高复杂性的混沌系统。本文采用理论分析、数值仿真和电路实验的方法,研究了基于简化Lorenz系统的超混沌系统和多翼吸引子的设计
高校思想政治理论课要适应新时代的发展和需要,坚持改革创新,不断提升教学质量。济南大学马克思主义学院对"中国近现代史纲要"专题教学模式进行了有益的探索,逐步形成了较为
随着我国汽车时代的到来,“停车难”是一个亟待解决的大问题,利用停车场现有的摄像头,对停车场车辆和空车位进行精准识别和定位是一种高效率、低成本的解决方案。近年来,以NVIDIA为代表的高性能计算开发商引领算力跨越式发展;卷积神经网络统领了整个图像领域,取得一项项辉煌成果。图像语义分割以像素级精确度定位停车场中的车辆,其中,全卷积神经网络(FCNs)的出现为实例语义分割提供了新的前进动力。然而,首先大
酒精性肝病是长期无节制过度饮酒导致的肝脏损伤疾病,现已成为全球公共卫生问题之一。酒精性肝病以脂肪肝为典型代表,长期发展将导致肝炎、肝硬化甚至肝癌的发生,严重影响人们的生命健康。经大量科技人员的长期努力与实践,出现了多种治疗酒精性肝病的手段,其中临床上用得最多的是抗氧化剂等药物治疗及肝移植等非药物治疗,它们的出现给广大酒精性肝病患者带来了福音。然而,随着科学技术的不断发展及人们生活需求的不断提高,大