当今，世界新科技革命方兴未艾，综合国力竞争的焦点是科技，科技的本质在于创新。创新支撑发展，科技引领未来。2006年初，我国召开了新世纪第一次科学技术大会，制订并实施了国家中长期科学和技术发展规划纲要，提出了建设创新型国家的目标。本文以此为背景，通过对创新、科技创新和政府行为等相关概念的界定，分析了新时期科技创新与政府行为的关系，明确了政府行为在科技创新中的定位和所面临的新要求，并对政府行为创新的对策进行了探讨。政府是科技创新系统中的重要部分，政府行为在科技创新的整个过程中发挥着不可替代的作用，合理的政府行为会促进科技创新，不当的政府行为又可能会限制科技创新的进行。新时期，我国的政府不是科技创新的主体，而是扮演着科技创新的组织引导者和协调服务者的角色。针对科技创新对政府行为提出的新要求，政府需要进行指导行为、组织行为、协调行为、服务行为和控制行为的创新，需要坚持以人为本与人的全面发展观、可持续发展观、走中国特色自主创新道路的观念为指导，制定科学的科技战略、科技计划和科技人才政策；对科技创新主体和过程进行组织，使企业成为创新主体，加大政府R&D投入，并合理使用经费，深化科技体制改革；促进科技创新主体的协调和产学研的协调；建设科技中介服务体系，优化文化环境和法制环境；对科技创新人员行为、科技创新过程和科技成果进行控制。