横断山区因其独特的地理风貌，山川湍流纵横交错，使得湍蛙属物种演化在这一地区极为复杂多样，多年来该地区的湍蛙属物种演化和系统发育关系一直未得到解决。本文分2章详细探讨了横断山区湍蛙属物种分化关系。　　 首先运用分子生物学方法，测定了横断山区南段及其南延地区，即云南境内湍蛙属物种线粒体12S rRNA，16S rRNA和Cyt6基因序列，合计1614bp，其中变异位点513，简约性位点370，颠换转换比为3.6。采用MB法和MP法构建系统发育树显示，横断山区云南境内湍蛙属物种明显的分为3大类群，类群Ⅱ与类群Ⅲ为四川湍蛙种组内物种，类群Ⅰ为山湍蛙种组，各类群内物种关系较为明确，但各类群间的分化关系在MB和MP中的分化不一致，且支持率也不高。系统发育树显示，密点湍蛙（Amolops cealumnoctis），平疣湍蛙（Amolops tuberodpressus）、金江湍蛙（Amolops jijhiangensis）以及5个未定种各聚为单独的一支，且支持率较高。遗传距离特征显示他们与其亲缘关系最近的种之间的遗传距离均大于种内最大遗传距离0.009（平疣湍蛙绿春居群与永德居群）。因此支持密点湍蛙，平疣湍蛙，金江湍蛙的物种有效性。五个未定种中，Amolopssp.1因其形态特征明显区别于其他湍蛙，其形态特征和新种描述正在进一步整理中。其他4个未定种还需对其形态特征进行鉴别和描述后再做讨论，其有效性尚待研究。　　 因上述内容仅涉及横断山区云南境内物种，为进一步研究横断山区湍蛙属物种的系统发育关系，本文第3章收集GenBank中横断山区湍蛙属相关物种：崇安湍蛙Amolops chunganensis，理县湍蛙Amolops lifanensis，四川湍蛙Amolops mantzorum，（包含凉山湍蛙Amolops liangshanensis和康定湍蛙Amolops kangtingensis），棕点湍蛙Amolops loloensis，西域湍蛙Amolops marmoratus，棘皮湍蛙Amolops granulosus，丽湍蛙或片马湍蛙Amolops bellulus和绿点湍蛙Amolops viridimaculatus，以及本文第2章中所测定的物种，共计19种，41个个体。因GenBank中录入的大部分物种仅有12S rRNA和16S rRNA基因序列，本章中分析片段仅为1010bp，其中变异位点366，简约性位点259，颠换转换比为2.5。MB法和MP法构建系统发育树结果显示，横断山区湍蛙属物种亦明显的分为3大类群，在遗传距离特征和系统发育树的支持率上均低于第2章的分析结果，从侧面说明增加分析序列的长度对数据分析结果有明显提高。MB法中，四川湍蛙种组所含物种被类群Ⅰ--即山湍蛙种组分开：隶属于四川湍蛙种组的类群H先与山湍蛙种组（类群Ⅰ）相聚，但无支持率；而后与同样隶属于四川湍蛙种组的类群Ⅲ相聚。MP法中，三个类群间平行相聚，无法判定3个类群与山湍蛙种组和四川湍蛙种组的关系。本章所涉及的横断山区云南省和四川省湍蛙属物种在MB法中，除突吻湍蛙Amolops macrorhynchus外聚为一支，但支持率较小；MP法中，除西域湍蛙和突吻湍蛙外，其余湍蛙属物种聚为一支，且支持率为99，因此支持湍蛙属物种西南支为单系。　　 横断山区湍蛙属物种大致有14种：山湍蛙（Amolops monticola）、丽湍蛙、平疣湍蛙、金江湍蛙、绿点湍蛙、密点湍蛙、崇安湍蛙、西域湍蛙、棘皮湍蛙、棕点湍蛙、理县湍蛙、四川湍蛙（包括凉山湍蛙和康定湍蛙）、墨脱湍蛙（Amolopsmodogensis）、阿尼桥湍蛙（Amolops aniqiaoensis）。就本文研究结果显示，位于横断山区的湍蛙属物种不止14种：除未涉及西藏地区的墨脱湍蛙和阿尼桥湍蛙外，本文仅测定横断山区湍蛙属物种中的6种：山湍蛙、丽湍蛙、平疣湍蛙、金江湍蛙、绿点湍蛙、密点湍蛙，加入四川省物种后就有12种，文中5个未定种均显示出较高的支持率，遗传距离特征也异常明显。除Amolops sp.1具有鲜明的形态差异，其数据在整理外，其余4个未定种还需进一步从形态上加以研究、核实。