近年来,科技创新在企业乃至国家发展中的重要性日益突出,为在国际竞争中占据有利地位,世界各国都在积极出台相关政策鼓励企业开展研发创新活动。创业板市场作为支持国家创新战略的重要平台,聚集了一批包括电子信息技术等高新技术产业在内的中小公司,在建设创新型国家中发挥着至关重要的作用,其影响不容忽视。尤其是在现阶段,我国大力发展资本市场,不断推进市场改革,在十四五规划以及2035远景目标中提到了要全面实行注册制,这对于科技型的中小企业来说是发展的机遇。而内部控制作为企业防范风险的坚实屏障,是规范内部治理、实现企业经营目标的重要保障。对于研发创新这一类高风险的企业活动来说,健全的内控体系可以为其提供良好的研发环境,从而促进企业将研发投入进一步转化为实际收益。同时,作为企业的外部环境,地区的市场化发展程度也可能会影响到企业的内控治理以及经营活动。因此,从市场化角度来研究内控对于企业研发与绩效关系的影响具有重要的意义。本文以2015-2019年我国创业板企业为样本,基于技术创新理论、内部控制理论、委托代理理论和信号传递理论,采用面板数据回归的方法,检验研发投入对创业板企业绩效的影响,以及企业内部控制在两者关系之间起到的调节作用。同时,根据企业所处地区的市场化程度进一步对样本进行分组,分别探究不同的市场化发展程度对于内部控制调节作用所产生的影响。研究结果表明,企业的研发投入与企业绩效呈正相关关系,并且这种关系存在滞后效应。主要表现为企业的研发投入在当期、滞后一期及滞后二期对于企业绩效的促进作用都十分显著,并且相关系数在逐期增大。而内部控制在二者之间存在着正向的调节作用。通过对市场化程度分组的进一步研究发现,在高市场化地区,企业内部控制的调节作用会更加显著。从理论意义来看,本文在以往研究的基础上进一步探寻研发投入、内部控制与企业绩效三者的关系,并考虑到外部市场化程度给企业带来的影响,这将进一步丰富对相关理论的研究。而在实践层面上,本文根据实证结果对企业开展研发活动、完善内部控制以及政府进一步推进市场化改革提出了相关的对策及建议。对于企业层面:（1）企业要有长远的眼光,通过持续的研发创新活动提升自身实力,为企业在国际市场上的发展争取有利的地位;（2）要重视内部控制体系的建设,有效防范企业内外部可能存在的风险,为企业研发活动的开展提供保障。对于政府层面:（1）要加大市场在资源分配中的比重,减少政府的干预,深化要素市场化配置改革;（2）要进一步完善法律法规及监管机制,发挥中介组织的积极作用,为企业提供安心的研发环境。