本文运用企业管理理论和新公共管理理论，以中科院后勤转制单位为例，对其战略性管理体系下的财务绩效评价进行分析研究，提出其在财务绩效评价方面存在的问题，在此基础上，将经济增加值理论和平衡加分卡相结合，对目前的财务绩效评估进行实证分析。最后，根据我国政府对于国企内部管理和战略性管理体系的构建规定，从战略性管理角度提出了提高财务绩效评价效果的建议，并为我国后勤转制单位提供借鉴和参考，以期为深化机关后勤改革、推动机关后勤单位管理体系建设做出一点贡献。　　同时，通过本文的分析，期望政府部门能够运用新公共管理理论，借鉴企业管理理论的成功经验，将经济增加值和平衡记分卡等绩效管理理论运用到政府管理中，推动政府部门绩效评价效果的提升。　　在实施战略性管理过程中，涉及到一个很重要的问题就是财务绩效管理。将战略性管理融入到财务绩效管理过程中，是对财务绩效评价的一种创新和发展。通过财务绩效评价修正发展战略方向，在评价指标中加入战略性管理要素，在提升财务绩效的同时实现战略目标。