与逆境应答相关的大豆受体类激酶的研究

来源 :中国科学院遗传与发育生物学研究所 | 被引量 : 0次 | 上传用户:shekitito
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
根据本实验室聚类的unigenes数据库,筛选出大豆中的受体类激酶基因,初步解析了大豆受体类激酶家族的特征。同时,通过筛选与逆境应答有关的受体类激酶,克隆了2个应答非生物胁迫的基因,并对它们的生化特性及功能进行了研究。主要结果如下:   1.大豆受体类激酶的特征分析   以10条已报道的大豆受体类激酶的激酶结构域序列分别检索本实验室约5.6万unigenes数据库以及TIGR大豆TC数据库,综合两次检索的结果,得到650个非冗余的大豆受体类激酶的候选基因。通过系统分析,去除RAF和蛋白激酶的序列,确认了605个大豆受体类激酶基因。依照其各自激酶结构域的系统进化关系,可分为15个家族。最大的基因家族是LRR类,有257个成员。RLCK家族发现130个成员。属于S-domain家族的有56个。其它12个家族中受体类激酶的数目不等。参照拟南芥和水稻中75个亚家族的分类,15个家族细分为58个亚家族。大豆中存在水稻中特有的DUF26-Ia,RLCK-Os4,SD-1c和SD-2a亚家族,也存在拟南芥中才有的亚家族SD-1b和DUF26-Ⅰb。在LRR-Ⅴ,LRR-Ⅵ,LRR-Ⅷ-1,LysM和WAK亚家族中,通过系统进化分析,大豆,拟南芥和水稻的受体类激酶序列形成了同一进化分支。在LRK10L-2亚家族中,三个物种的序列形成彼此独立的进化分支。这一结果反映出,不同亚家族的序列进化模式是不同的。   2.大豆受体类激酶GmSIK1和GmSIK2的克隆和功能鉴定   在本实验室大豆unigene数据库检索到的受体类激酶基因的基础上,通过RT-PCR方法,检测了其中338个基因在ABA、高盐和冷胁迫下的转录水平。筛选20个基因分别在ABA、低温和高盐处理中有表达差异。选取在ABA、SA、干旱、高盐和冷胁迫下都呈现出表达差异的GmSIK1和GmSIK2基因作进一步研究。   用RACE方法克隆了GmSIK1和GmSIK2的全长cDNA。GmSIK1和GmSIK2激酶结构域在Mn2+和Mg2+条件下具有自身磷酸化活性,而Ca2+存在时没有激酶活性。它们都可以磷酸化MBP蛋白。GmSIK1和GmSIK2基因过量表达的百脉根植株在正常条件下与野生型表型无明显差异,在盐或旱胁迫下,其耐盐/旱性明显高于对照,转基因植株中脯氨酸含量高于对照。盐胁迫下,相对电导率和丙二醛的累积均比对照低,说明胁迫下转基因植株细胞受到的伤害小于对照。下游基因的初步分析表明,GmSIK1基因调控了P5CS基因的表达。   应用Tail-PCR的方法克隆了GmSIK1和GmSIK2基因在大豆中的启动子序列。在转拟南芥分析中,GmSIK1启动子主要在叶肉细胞中表达,包括气孔和腺毛。在幼苗的根中表达较弱。并且启动子受盐诱导。GmSIK2启动子主要在维管组织中表达,在花瓣、花萼、夹、柱头等器官也有表达。从转基因百脉根的结果看,GmSIK2启动子也在维管组织中表达,这与拟南芥的结果是一致的。
其他文献
实时图象处理在多媒体、HDTV、图象通信等领域有着非常广泛的应用.1991年以来,国际标准化组织(ISO)和国际电信联盟(ITU)相继推出了静态图象压缩国际标准JPEG和运动图象压缩国
基于由通用工作站和PC服务器连接而成的机群系统的并行处理技术的兴起为该领域开辟了一条新路.该文在与"国家智能计算机研究开发中心"合作完成"曙光天演镜像文件服务器"的基
该文首先对无载频脉冲探地雷达的发展历史、工程应用概况以及技术现状和未来发展趋势进行了较为详细地讨论,为了利用FD-TD方法模拟计算探地雷达的工作性能,该文对FD-TD方法中
MUSICAM算法在保证声音信号高质量音质的前提下,具有很高的数据压缩率.在主观质量、数据率和自理复杂度等方面提供了最佳的折中,具有广泛的应用前景,可用于数字音频广播、高
该文是在锁相环的基本原理的基础之上,通过对M/N环路的原理和性能的分析,设计出实用的适合射频识别系统应用的微波智能频率合成源.它由三部分构成:1.以大规模集成电路MC14515
相变存储器由于具有非挥发性、可微缩性、与CMOS工艺兼容等优点,已经替代部分手机中FLASH存储芯片而实现应用,然而要想替代DRAM则依然任重而道远。这主要是由于目前以Ge2Sb2Te5
目的:探究早期活动与康复训练对机械通气患者活动能力及并发症的影响.方法:择取2018年4月~2019年4月间本院收治的ICU机械通气患者82例进行分析,随机分组为参照组、研究组.参照
目的:比较立体定向微创手术与开颅手术在脑出血治疗中的疗效与安全性.方法:以我院收治的82例脑出血患者为观察对象,按照治疗方式的不同分为两组,41例行开颅手术患者为对照组,
青光眼是导致失明第二常见的疾病,并极难治愈,眼内压的大幅度变化是青光眼的主要病症,对眼内压的实时检测并及时的采取治疗措施可以控制青光眼的恶化。本文研制出一种植入到前房
目的:分析前列地尔注射液的药理作用.方法:以“前列地尔”为检索词,医学相关文献中前列地尔注射液的药理作用进行研究,分别选取从2018年5月-2019年5月收治于我院的84例急性心