玉米细菌性枯萎病是玉米上的一种毁灭性的病害，尤其对甜玉米更甚，在严重情况下可造成颗粒无收。目前我国尚无正式分布的报道，是被我国列为禁止进境一类检疫性有害生物。在我国口岸的检疫中，一直沿用传统的分离培养、生理生化鉴定、噬菌体检测、免疫荧光染色和致病性试验等检验的方法。应用该类方法耗时长、效率和灵敏度均较低，且经验性很强，又往往难以确定准确的细菌种类，不适合口岸快速验放的要求，难以标准化和大规模的推广应用，这些也正是目前细菌病原缺乏标准检测方法的重要原因。建立快速、准确的检测方法迫在眉睫、意义重大。 本研究成功建立了玉米细菌性枯萎病菌检测的TqMan探针实时荧光PCR检测方法，且在国内外未见相同方法报道。将玉米细菌性枯萎病菌16S rDNA基因克隆测序，根据本细菌与其它细菌菌株16S rDNA序列差异，设计出对玉米细菌性枯萎病菌具有稳定点突变的特异性探针，除泛菌属3个种和欧氏菌属3个种外，还对假单胞菌属1个种，黄单胞菌属1个种，棒形杆菌属1个种，短小杆菌属1个种以及5种植原体进行了实时荧光PCR。结果表明，只有玉米细菌性枯萎病菌产生荧光，其他细菌和植原体都没有荧光产生。且绝对灵敏度比凝胶咆泳高100倍，达到2.53×10~6个阳性分子。检测的灵敏度为10~4 CFU／mL的菌悬浮液，相当于4个细菌细胞的基因，灵敏度高，也就是说，反应体系中只要有2个活细菌，实时荧光PCR就能检测到。相对灵敏度为10′CFU／mL，而且整个检测过程只需2小时，由于实验采用独特全封闭反应管及光电传导系统，不用凝胶电泳，降低了污染。 本方法特异性强、灵敏度高、可以快速、直接检测到玉米细菌性枯萎病菌，在检验检疫工作中有广阔的应用前景。