桃[Prunus persica(L.)Batsch]分子标记连锁图谱的构建

来源 :吉林农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:robot2004
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桃起源于中国,有丰富的种质资源和育种经验,但在基础研究方面和国外有很大的差距,这在很大程度上制约了资源的利用和开发,也制约了品种选育工作的速度.欧洲、美国和日本都相继启动了桃基因组研究计划,目前为止国外已先后发表了多张桃遗传连锁图,而国内尚未有公开发表的桃遗传连锁图,研究进展远远落后于先进国家水平.另外,就目前发表的图谱来看群体数目都比较小,许多标记不能定位在连锁图上.该文利用大久保和兴津油桃杂交的F<,2>代109株群体,构建由AFLP(扩增片段长度多态性,Amplified Fragment Length Polymorphism)、SSR(简单序列重复,Simple Sequence Repeat)、SCAR(序列特异扩增,Sequence Characterized Amplified Regions)标记组成的遗传图谱,旨在丰富分子标记资料,构建较高密度的分子遗传图,为重要性状基因定位奠定基础,以期发挥资源优势,加快品种选育步伐,进一步推动桃遗传学和桃基因组研究的深入.主要研究结果如下:(1)建立稳定、高效的桃AFLP分析体系:制备高质量的基因组DNA是AFLP技术中非常关键的步骤.预扩增引物可选择E+0/M+0或E+0/M+C组合,对扩增条带数的影响不显著;选择性扩增引物组合E+2/M+3、E+3/M+3都适合桃比较基因组研究,但从揭示的多态性来说还是前者较高.该实验采用银染显色法对AFLP扩增产物进行检测,银染显色具有避免同位素污染、成本低、检测时间缩短、染色后可长期保存、便于目的片段的回收等优点,是一种安全、快速而有效的方法.(2)采用AFLP、SSR、SCAR标记,以大久保、兴津油桃F2代109株群体为试材,构建桃遗传连锁图.利用128对AFLP引物组合、16对SSR引物、3对SCAR引物对亲本进行多态性分析.选择扩增稳定、多态性丰富的引物(包括54对AFLP引物组合、3对SSR引物、3对SCAR引物)进行群体分离分析,获得分离标记共173个,卡方检验44个标记发生偏分离.遗传图谱的分辨率和精度在很大程度上取决于群体大小.因此确定合适的群体大小是十分重要的.该实验群体是在350株杂交后代中随机选择的109株个体,多态性分析表明,来自两亲本的位点符合1:1比例,总体上未出现严重的偏分离.从验证的多态性片段结果来看大多数符合孟德尔遗传规律,表明群体的大小符合构建连锁图的要求,在果树中是不可多得的研究材料.AFLP标记在亲本及后代群体中表现相对低水平的多态主要是因为桃栽培品种中高度的近交所引起的,尤其是西方桃品种多数起源于19世纪中国南部引入的少数基因型,遗传变异小.
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