医药行业在我国国民经济中有着举足轻重的地位。在我国医药行业中,中小医药企业数量居多,就上游原料制造商或下游医药经销商的数量而言,其占总体的比值都超过90%。虽然我国中小企业对我国经济发展有重大的意义,但是其贷款融资难问题一直没有得到良好的改善。为此,本文重点分析了中小型医药行业供应链融资方面,对医药企业经营和管理提供良好的供应链融资体系,希望能够促进供应链金融理论体系的完善。通过选取医药行业这一特殊市场,以中小型医药企业为研究对象,本文首先阐述了供应链融资的相关理论知识,通过理论研究和实证检验相结合的方法,论证了开展供应链融资业务是可以有效解决中小型医药企业的融资问题。第一,以自偿性贸易融资、交易成本以及信息不对称为理论基础,主要论证了供应链融资业务能够有效缓解中小型医药企业的融资困境,提高中小医药企业的信用水平;第二,本文以中小医药企业的融资问题为出发点,选取W医药企业为研究对象,在基于层次分析法和功效系数法的理论下论证了供应链融资能够提高医药行业中小企业的信用评级;第三,通过理论与实证分析相结合,论证开展供应链融资模式有助于缓解医药行业中小企业的资金压力,并提出了几点对策,如建立中小金融机构、交易型电子商务平台等。