银屑病易感区域PSORS9精细定位及候选基因研究

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第一部分 银屑病易感位点PSORS9精细定位 背景 寻常性银屑病是一种慢性炎症性皮肤病,人群中患病率约为0.1-5%。本课题组先前对61个中国汉族寻常型银屑病家系进行了全基因组扫描,在6p21区域获得强连锁信号(max NPL=4.58,p=0.000032);在4q28-32区域获得了提示性连锁信号(max NPL=3.69,p=0.00033),被OMIM收录并命名为PSORS9。该区域遗传距离约为35 cM,包含有300多个基因。 目的 在中国汉族人群中精细定位4号染色体长臂上银屑病易感位点PSORS9,为该区域内银屑病易感基因的克隆奠定基础。 方法 用覆盖4号染色体长臂4q28-32的13个微卫星标记对151个寻常型银屑病家系共759个体(包括404名患者和355名非患者)进行基因组扫描研究。以GENEHUNTER软件(2.0 Version)对基因分型结果进行参数和非参数连锁分析:以平均发病年龄作为变量进行序秩分层分析;以Genefinder 1.0软件估算易感基因所在区域的可信区间及支持性区间。 结果 ①多点非参数连锁分析显示在146.35-169.55 cM之间NPL值均大于3,在159.65 cM(D4S2997-D4S3033之间)处获得最大的多点NPL值4.03(p=0.000003)。多点参数连锁分析表明在150.95-163.75 cM之间HLOD值均大于3,在159.35 cM(D4S2997-D4S3033之间的位置)处获得最大HLOD值4.53(α=46%)。90个新增家系中,在标记D4S413-D4S2997之间得到最大的多点NPL值=3.15(p=0.00004)和HLOD值=4.33(α=69%),在该90个新增家系中得到的HLOD值也达到全基因显著连锁标准;②在平均发病年龄<16.33y的31个银屑病家系亚群中,获得最大OSA-LOD值4.24(p=0.017)。对该银屑病家系亚群进行的多点参数分析,在标记
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