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金融体系的资本积累功能、资金配置功能和风险管理功能有助于促进自主创新，但中国金融体系在此三个方面还存在着一定的问题，具体体现在：金融结构与创新主体多样化和个性化的融资需求之间存在结构性不协调，自主创新融资困难；金融信息揭示功能不健全，资金配置效率不高；经济及金融存在体制性缺陷，金融风险管理功能不突出。针对这些问题，提出了相应的解决对策。