时间延迟基因调控网络重构的决策树方法研究

来源 :中国科学(C辑:生命科学) | 被引量 : 0次 | 上传用户：ribenandchina

【摘要】

：

基因调控网络的重构是功能基因组中最具挑战性的课题之一．针对基因间转录调控的时间延迟性,提出了一种寻找时间延迟调控关系的方法：多点延迟调控网络算法,简称TdGRN (time-delayed gene regulatory networking)。该方法根据时间序列基因表达谱数据,构建时间延迟基因表达矩阵,利用有监督决策树分类器方法和随机重排技术挖掘基因之间的时间延迟调控关系,从而构建时间延迟的基因

【作者】

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姜伟李霞郭政李传星王丽虹饶绍奇

【机构】

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哈尔滨医科大学生物信息学系,哈尔滨,150086哈尔滨工业大学计算机学院,哈尔滨,150001;哈尔滨医科大学生物信息学系,哈尔滨,150086;哈尔滨工业大学计算机学院,哈尔滨,150001;同济大

【出处】

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中国科学(C辑:生命科学)

【发表日期】

：

2005年06期

【关键词】

：

基因调控网络时间延迟决策树分类器

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