【摘 要】
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细胞色素P450(cytochrome P450,CYP)酶存在于所有哺乳动物中,它们从共同的祖先通过基因倍增进化而来,以一种"爆炸性"的趋势形成了庞大的超家族。除代谢脂质等内源性物质外,部
【机 构】
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上海交通大学生命科学技术学院; 上海科技大学生命科学与技术学院; 中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所系统生物学重点实验室; 上海生物信息技术研究中心;
【基金项目】
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国家“973”计划项目(2011CB910204,2011CB510102,2010CB529200);科技部重大仪器专项项目(2012YQ03026108);国家科技支撑计划项目(2013BAI101B09);国家自然科学基金项目(31301032);中国博士后科学基金项目(2013M531226)~~
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细胞色素P450(cytochrome P450,CYP)酶存在于所有哺乳动物中,它们从共同的祖先通过基因倍增进化而来,以一种"爆炸性"的趋势形成了庞大的超家族。除代谢脂质等内源性物质外,部分CYP酶还在药物等外源性物质的代谢方面起到重要作用。通过收集和注释哺乳动物CYP酶的序列发现,家族规模发生显著变化的七个活跃亚家族均属于CYP1~4家族,相比之下,非CYP1~4家族的家族规模则基本保持稳定。基于二级结构的预测结果,六段底物识别位点(substrate recognition sites,SRSs)的进化速率在CYP1~4家族中,特别是活跃的亚家族中,也显著快于非CYP1~4家族。同时,SRS1~3的进化速率显著快于SRS4~6,说明SRS1-3在更大程度上决定了CYP酶在进化过程中所获得的新功能。
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