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对浙江瑞安、福建宁德、福建东张水库3个地理群体共31例香鱼（Plecoglossus altivelis）的线粒体细胞色素6（Cyt6）基因和线粒体D—loop区序列进行了PCR扩增、序列测定、核苷酸组成和多态性分析。Cyt b基因中，A、T、C和G4种核苷酸的比例分别为19．72％、29．71％、32．25％和18．32％，A＋T含量为49．43％，G＋C含量为50．57％。D—loop区序列中，A、T、C和G4种核苷酸的比例分别为29．99％、29．29％、23．80％和16．92％，A＋T含量为59