【摘 要】
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iPath是一个用于细胞路径可视化和代谢途径分析的免费网页应用程序。iPath中的路径是通过交互式浏览器查看的,它提供各种代谢途径的直接导航,使人们能够方便地访问相关的化合
【机 构】
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山东大学海洋研究院,天津科技大学印度洋生态系统研究中心
【基金项目】
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国家自然科学基金(41876134,41676112),天津市自然科学重点基金(17JCZDJC40000),天津市“131”创新群体项目(20180314),天津市高等学校创新团队培养计划(TD12-5003),长江学者奖励计划(T2014253)
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iPath是一个用于细胞路径可视化和代谢途径分析的免费网页应用程序。iPath中的路径是通过交互式浏览器查看的,它提供各种代谢途径的直接导航,使人们能够方便地访问相关的化合物和酶。本文简要介绍了最新的iPath3.0版本(http://pathways.embl.de)(基于4个KEGG的全局地图,158个传统的KEGG路径图,192个KEGG模板,以及其他代谢元素,组成了一个相互连接、手工绘制的代谢网络),并举例说明其在生物海洋学研究中的应用,以期引起国内学者对此工具的重视,促进其在生物海洋学研究中的应
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