影响伪狂犬病病毒同义密码子用法特点的因素分析

来源 :浙江大学学报:农业与生命科学版 | 被引量 : 0次 | 上传用户:say_8139
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为了充分了解伪狂犬病病毒基因组结构和病毒进化机制,计算伪狂犬病病毒各基因(组)Nc值、RSCU值、GC3s含量和双核苷酸组成,分析伪狂犬病病毒密码子用法特点.采用目前最普遍使用的多变量统计分析方法(对应分析)分析影响伪狂犬病病毒基因组同义密码子用法偏爱性的因素.结果表明:①在GC含量丰富的伪狂犬病病毒基因组中,所有基因都偏爱于以G或C结尾的密码子;②伪狂犬病病毒对CpG、CpC、GpC和GpG4种双核苷酸具有显著偏爱性,而较少使用ApA、ApT、TpA和TpT4种双核苷酸;③碱基组成限制、碱基突变压力、翻
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