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HLA-B27由12个紧密相关的等位基因（B*2701～12）组成，不同B27亚型的可变区氨基酸序列不完全相同，导致与不同亚型结合的肽的特性也不相同；而B*2710与B*2705结合的肽序列一致，但由于出现Val>Gln152改变，使二者在T细胞识别中存在差异；B*2708、*2711、*2712均为B27变种，属于与Bw6相关的亚型。B27亚型分布存在种群差异性，以B*2705分布最广。主要的AS易感基因有B*2705、*2704和*2702，而B*2706、*2709可能为保护基因。转基因模型的建立，可望对B27的功能及其与AS的关系有更清楚的认识。