【摘 要】
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目的对新分离的铜绿假单胞菌dsDNA溶原性噬菌体PaP3进行基因组测序.方法用CsCl梯度离心纯化噬菌体PaP3颗粒,提取噬菌体基因组DNA,建立shot-gun随机文库,从文库中随机挑取克隆
【机 构】
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第三军医大学基础医学部微生物学教研室、重庆市微生物工程重点实验室
【基金项目】
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国家自然科学基金，重庆市科技攻关项目
论文部分内容阅读
目的对新分离的铜绿假单胞菌dsDNA溶原性噬菌体PaP3进行基因组测序.方法用CsCl梯度离心纯化噬菌体PaP3颗粒,提取噬菌体基因组DNA,建立shot-gun随机文库,从文库中随机挑取克隆进行测序并完成序列组装,同时通过限制性内切酶图谱结合酶切片段的变性、复性实验分析基因组末端.结果共进行了778条序列的测定与拼接,测序量达到13.5倍覆盖率,得到一条长为44 249 bp 的重叠群,此重叠群错误率为9.46ERR/10KB,测序结果和酶切图谱分析表明该PaP3基因组是一44 249 bp长的线性平端
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