【摘 要】
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目的基于基因组高通量测序筛选脑胶质瘤组织中异常表达的长链非编码RNA(lncRNA),并验证其结果。方法收集19例脑胶质瘤组织和5例正常脑组织,进行基因组高通量测序,应用edgeR软
【机 构】
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湖南中医药大学第一附属医院,湖南中医药大学
【基金项目】
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国家自然科学基金资助项目(81803641),湖南省自然基金面上项目(2020JJ4069),长沙科技局科技计划项目(kq1706060)。
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目的基于基因组高通量测序筛选脑胶质瘤组织中异常表达的长链非编码RNA(lncRNA),并验证其结果。方法收集19例脑胶质瘤组织和5例正常脑组织,进行基因组高通量测序,应用edgeR软件进行两样本间差异基因分析,计算两样本间的差异倍数和P值,筛选出差异表达的lncRNA。另收集70例脑胶质瘤组织和20例正常脑组织,采用qPCR法验证脑胶质瘤组织中表达上调和下调前3位lncRNA的表达水平。结果脑胶质瘤组织中存在明显的差异表达的lncRNA共3040个,其中表达上调1233个、下调1807个。qPCR结果显示
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