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医学昆虫是具有医学和经济双重意义的重要媒介生物，严重影响人们生活质量与身体健康。防制技术的进步是基于对其生物学认识（如生态习性、生理特点）的深入，但目前从基因组角度的了解却知之甚少。为此，研究人员采用下一代高通量测序技术从组学角度进行研究，其中454焦磷酸测序技术兼具经济性与读长最长的特点，尤其适合于无参考基因组的非模式医学昆虫应用。本文简介了454测序原理，主要从技术特点、应用范围等角度将其与Solexa测序、基因芯片技术进行比较；综述了近期在医学昆虫领域取得的研究结果，包括抗药性分子机制、虫媒病原体检