【摘 要】
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长链非编码RNA (lncRNA)是一类长度大于200个核苷酸的非编码RNA，能够在表观遗传水平、转录水平和转录后水平调控基因表达，广泛参与植物的生长发育、抗逆、生理和病理过程。广藿
【基金项目】
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国家自然科学基金项目(81773829);广东省科技计划项目(2017A030303081, 2017A030303082 )共同资助
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长链非编码RNA (lncRNA)是一类长度大于200个核苷酸的非编码RNA，能够在表观遗传水平、转录水平和转录后水平调控基因表达，广泛参与植物的生长发育、抗逆、生理和病理过程。广藿香为广东道地药材之一，也是医药领域和化工领域的重要天然原料。为了更好地开发和利用这一重要资源，本研究以广藿香为实验材料，在全长转录组测序的基础上，利用四个软件对134 647个转录本全长序列进行了蛋白编码潜能预测，最终获得4 106个lncRNAs。对这些lncRNAs的长度和数量作统计分析。结果显示，最短为280 nt，最长为8941 nt，平均长度为1 084 nt；大部分 lncRNAs 的长度介于280～1 000 nt (61.447%)，在1 001～2 000 nt 和2 001～4 000 nt的长度范围内也发现有较多的lncRNAs，分别为 23.015%和 15.270%；但在 4 001～8 941 nt 的长度范围内，总共只有11个lncRNAs (占总量的0.268%)。本研究为广藿香 lncRNA 鉴定和后续的功能分析提供了重要的基础。
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