【摘 要】
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为了解南海东北部、琼东和北部湾3处水域内浮游细菌的群落结构和多样性特征,利用Illumina Miseq高通量测序技术对40个站位64个细菌样品的16S rRNA基因V3-V4高变区进行测序分析.在97％序列相似性水平条件下,调查区域内总共鉴定2891个操作分类单元(operational taxonomic unit,OTU),单样品OTU个数变化范围为249～1250.鉴定OTU隶属于37个细菌门、101个纲、243个目、404个科、753个属(包含未分类部分).变形菌门(Proteobacteria
【机 构】
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上海海洋大学水产与生命学院,上海 201306;中国水产科学研究院东海水产研究所,上海 200090;上海海洋大学水产与生命学院,上海 201306
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为了解南海东北部、琼东和北部湾3处水域内浮游细菌的群落结构和多样性特征,利用Illumina Miseq高通量测序技术对40个站位64个细菌样品的16S rRNA基因V3-V4高变区进行测序分析.在97％序列相似性水平条件下,调查区域内总共鉴定2891个操作分类单元(operational taxonomic unit,OTU),单样品OTU个数变化范围为249～1250.鉴定OTU隶属于37个细菌门、101个纲、243个目、404个科、753个属(包含未分类部分).变形菌门(Proteobacteria)、蓝细菌门(Cyanobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)和拟杆菌门(Bacteroidota)是4个最具数量优势的细菌门,分别占研究采集样品序列总数的39.24％、29.67％、10.97％和10.80％;蓝细菌纲(Cyanobacteria)、α-变形菌纲(Alphaproteobacteria)、γ-变形菌纲(Gammarproteobacteria)、拟杆菌纲(Bacteroidia)和酸微菌纲(Acidimicrobiia)是样品中5个具数量优势的细菌纲,序列数占比分别为29.67％、22.76％、16.47％、10.71％和8.52％;聚球藻属(Synechococcus)、原绿球藻属(Prochlorococcus)、Candidatus Actinomarina、蓝细菌属(Cyanobium)为数量占优的细菌属.Wilcoxon秩和检验表明,研究区域表层水体浮游细菌群落结构没有显著的空间差异,南海东北部水域群落多样性通常较高,显示珠江河口淡水注入以及上升流等物理事件在区域内营造了较为异质化的生境.浮游细菌群落呈现较为显著的层化现象,底层群落具有更高的多样性和特异性生物类群.
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