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在断裂的动脉粥样硬化斑块上血栓形成是心肌梗塞和不稳定性心绞痛等急性冠状动脉综合征的重要发病机理。心肌梗塞为冠状动脉急性完全闭塞所致，而不稳定性心绞痛则大多继发于附壁血栓形成。血栓形成对慢性动脉粥样硬化疾病的进展以及冠心病脉血管成形术后再狭窄也有作用。对血栓的治疗效果取决于药物预防血栓扩展、溶解血栓纤维蛋白成分或预防血小板进一步聚集的能力。其他治疗措施的效果则取决于冠状动脉内技术开通冠状动脉的能力。