胶质瘤中PTB调控长非编码RNA选择性剪接的筛选

来源 :基础医学与临床 | 被引量 : 0次 | 上传用户：lovepengchen

【摘要】

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目的探究在神经胶质瘤发生发展过程中PTB调控选择性剪接的长非编码RNA。方法全转录组芯片分析筛选受PTB蛋白介导影响选择性剪接的长非编码RNA。提取胶质瘤和正常细胞系及临床

【作者】

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卫群芳朱丽媛韩为彭小忠

【机构】

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中国医学科学院基础医学研究所、北京协和医学院基础学院医学分子生物学国家重点实验室生物化学与分子生物学系

【出处】

：

基础医学与临床

【发表日期】

：

2018年6期

【关键词】

：

选择性剪接长非编码RNA PTB 神经胶质瘤 alternative splicinglong noncoding RNAPTBglioma

【基金项目】

：

国家重点研发计划（2016YFA0100702,2016YFC0902502）, 国家重点基础研究发展计划（2013CB531304）, 国家自然科学基金（31301152,31370789,31670789,31671316）, 中国医学科学院创新基金（CIFMS,2016-12M-1-001,2016-12M-1-004）

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目的探究在神经胶质瘤发生发展过程中PTB调控选择性剪接的长非编码RNA。方法全转录组芯片分析筛选受PTB蛋白介导影响选择性剪接的长非编码RNA。提取胶质瘤和正常细胞系及临床病例组织样品和敲低PTB的神经胶质瘤细胞总RNA,实时荧光定量PCR验证候选基因不同剪接异构体的表达及比值变化。核质分离实验鉴定长非编码RNA细胞定位。结果筛选出16条受PTB蛋白介导影响选择性剪接的长非编码RNA,其中linc00882的不同剪接异构体的表达模式受PTB调控所产生的差异最明显。检测到linc00882定位于细胞质。结论

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