【摘 要】
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目的了解宜春市2011年-2013年分离的B型流感病毒株HA1基因变异情况。方法核酸提取采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增病毒基因后进行核苷酸序列测定,用DNAStar510、Bio Edi
【机 构】
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宜春市疾病预防控制中心,江西省疾病预防控制中心,
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目的了解宜春市2011年-2013年分离的B型流感病毒株HA1基因变异情况。方法核酸提取采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增病毒基因后进行核苷酸序列测定,用DNAStar510、Bio Edit(Version510)、Mega3.1生物软件对测序结果进行分析处理。结果 Victoria系11株,Yamagata系7株进行HA1基因测序,与当年WHO对北半球推荐的疫苗株进行比对,2011年、2012年、2013年氨基酸同源性分别为99.1%、99.4%~99.6%、99.4%~99.6%;氨基酸替换数分别为3个、3个、4.5个,其中2012年1处、2013年2处变异位于抗原决定簇;种系进化树上,分成Victoria系和Yamagata系两大分支,各年份同系分离株与疫苗推荐株均在同一分枝上,亲缘性较近;HA1基因序列二硫键未发生变异;糖基化位点仅2013年两毒株分别在533~535、546~548发生了变异。结论 2011年-2013年宜春市B型流感HA1基因虽然有氨基酸替换,但还没有出现实质性的转变,且与疫苗代表株同源性极高,均达到99.1%以上,因此疫苗仍具有较好的保护作用。
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