桥蛋白基因对膀胱尿路上皮癌预后评估的意义及功能研究

来源 :临床内科杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户：zh_engxu

【摘要】

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目的通过生物信息学方法对桥蛋白基因(GPHN)进行功能探讨,分析其药物敏感性,并通过生存分析判断其在膀胱尿路上皮癌(BLCA)预后评估中的意义.方法在TCGA数据库获取BLCA的mRN

【作者】

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曾梓航李佳丽刘嘉彬李硕张冉孟详喻李胜杜雪晴

【机构】

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武汉大学中南医院武汉大学第二临床学院,武汉大学中南医院泌尿外科,武汉大学中南医院生物样本库湖北省人类遗传资源保藏中心

【出处】

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临床内科杂志

【发表日期】

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2019年1期

【关键词】

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膀胱尿路上皮癌生物信息学 TCGA GEO GPHN 富集分析 Bladder cancer Bioinformatics The Cancer Genom

【基金项目】

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中央高校基本科研业务费专项资金资助项目(2042018kf0077),武汉大学珞珈青年学者科研基金项目(351人才计划),武汉大学中南医院科技创新培育基金资助项目(znpy2017050).

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目的通过生物信息学方法对桥蛋白基因(GPHN)进行功能探讨,分析其药物敏感性,并通过生存分析判断其在膀胱尿路上皮癌(BLCA)预后评估中的意义.方法在TCGA数据库获取BLCA的mRNA测序(mRNA-seq)及相应临床数据;利用R语言Survival程序包对GPHN表达运用Kaplan-Meier法及Cox回归进行生存分析;联合基因表达文库数据库(GEO)多数据集对不同GPHN表达的BLCA患者进行Meta分析;对GPHN差异表达基因(DEGs)进行基因本体(GO)及京都基因与基因组百科全书(KEG

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