基于RAD-seq简化基因组测序的金湖乌凤鸡遗传进化研究

来源 :福建农林大学学报:自然科学版 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zhoujhipanel
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利用RAD-seq简化基因组测序鉴定金湖乌凤鸡与其它18个地方鸡种、2个引入肉鸡品种的SNP标记,计算遗传统计量,分析金湖乌凤鸡的遗传多样性和遗传结构,鉴定受选择基因.结果表明,在金湖乌凤鸡中鉴定出SNP标记325 531个,SNP标记在染色体上均匀分布.金湖乌凤鸡的观察杂合度Ho为0.213 6、核苷酸多样度Pi为0.240 4,近交系数Fis为0.111 6,与其它18个地方鸡种相比遗传多样性较为丰富;金湖乌凤鸡的平均遗传分化系数Fst为0.155 6,平均基因流Nm为1.398 2,在系统发育树中形
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