【摘 要】
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在复杂疾病的全基因组关联研究中，人群分层现象会增加结果的假阳性率，因此考虑人群遗传结构、控制人群分层是很有必要的。而在人群分层研究中，使用随机选择的SNP的效果还有待进
【机 构】
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生物芯片北京国家工程研究中心,博奥生物有限公司
【基金项目】
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国家高技术研究发展计划项目(863计划)(编号:2009AA022708)资助
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在复杂疾病的全基因组关联研究中，人群分层现象会增加结果的假阳性率，因此考虑人群遗传结构、控制人群分层是很有必要的。而在人群分层研究中，使用随机选择的SNP的效果还有待进一步探讨。文章利用HapMap Phase2人群中无关个体的Affymetrix SNP 6.0芯片分型数据，在全基因组上随机均匀选择不同数量的SNP，同时利用f值和Fisher精确检验方法筛选祖先信息标记（Ancestry Informative Markers，AIMs）。然后利用HapMap Phase3中的无关个体的数据，以F-st
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